數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)

在這些數(shù)據(jù)類(lèi)型里，生信學(xué)習(xí)者最需要熟悉的是向量和數(shù)據(jù)框。

part1：向量

1. 標(biāo)量和向量的區(qū)分
   標(biāo)量：一個(gè)元素組成的變量
   向量：多個(gè)元素組成的變量

   
   
   微信圖片_20220506223514.png

2. 從向量中提取元素
   （1） 根據(jù)元素位置

這里的x是你剛才賦值的變量名，根據(jù)自己的情況來(lái)修改

x[4] #x第4個(gè)元素
x[-4]#排除法，除了第4個(gè)元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4個(gè)元素
x[-(2:4)]#除了第2-4個(gè)元素
x[c(1,5)] #第1個(gè)和第5個(gè)元素```

（2） 根據(jù)值
x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素```

Part2：數(shù)據(jù)框

（1）讀取本地?cái)?shù)據(jù)

微信圖片_20220506225559.png

圖片引用生信星球

（2）設(shè)置行名和列名
X<-read.csv('doudou.txt') #在示例數(shù)據(jù)里有doudou.txt 注意這里的變量X是一個(gè)數(shù)據(jù)框
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默認(rèn)值的行名就是行號(hào)，1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回?cái)?shù)據(jù)，左上角第一格為空，R會(huì)自動(dòng)補(bǔ)為x,用這個(gè)命令來(lái)修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列為行名

（3）數(shù)據(jù)框的導(dǎo)出
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改為逗號(hào)，字符串不加雙引號(hào)（默認(rèn)格式帶由雙引號(hào)）

（4）變量的保存與重新加載
這次沒(méi)有處理完的數(shù)據(jù)下次想接著用怎么辦?--學(xué)會(huì)保存和重新加載。保存的格式是RData。
save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存當(dāng)前所有變量
save(X,file="test.RData")#保存其中一個(gè)變量
load("test.RData")#再次使用RData時(shí)的加載命令

（5）提取元素

• X[x,y]#第x行第y列
• X[x,]#第x行
• X[,y]#第y列
• X[y] #也是第y列
• X[a:b]#第a列到第b列
• X[c(a,b)]#第a列和第b列
• X$列名#也可以提取列（優(yōu)秀寫(xiě)法，而且這個(gè)命令還優(yōu)秀到不用寫(xiě)括號(hào)的地步，并且支持Tab自動(dòng)補(bǔ)全哦，不過(guò)只能提取一列）

上述代碼和內(nèi)容均引用自生信星球
學(xué)習(xí)思維導(dǎo)圖

數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu).png

save(X,file="test.RData")這句代碼如果報(bào)錯(cuò)object X not found，是為什么，應(yīng)該怎么解決？

答：X文件不存在或者找不到，解決方法把想保存的文件賦值給X或者直接用保存文件名字。