原因：

造成這個問題的原因最有可能是使用了SVN或git。

你在新建工程時，使用了SVN或Git管理你的項目，然后直接在項目文件夾（Finder）內(nèi)刪除某個文件后，并沒有同步到SVN或Git上（雖然本地是刪除了，但是SVN或Git倉庫里還存在此刪除文件）。

親測有效的方法如下：

方法一：

Xcode->Preferences->Source->Enable Source Control 勾勾去掉
這個方法的確能解決問題，但是你有更新需要提交的時候還是得打開，不能從根本上解決問題。不推薦使用。

方法二：

找到報警信息，找到相應(yīng)文件夾，和相應(yīng)文件名稱，新建一個同名文件，拖入到工程內(nèi)，不要選擇copy，clean后，在工程中刪除此文件，一切都清凈了。

注意：是從工程中刪除哦~~~

我就是用這個方法解決的。

網(wǎng)上還有很多其他方法，匯總在這里，供大家參考：

方法一：

直接Commit一下你新建的，或者刪除的文件到SVN或Git上就行了。

方法二：

直接在終端下用SVN或Git命令刪除 missing file 文件（注意：需要cd到提示你missing file 文件的路徑下）
SVN :

svn delete nameOfMissingFile

Git：

git rm nameOfMissingFile

有不對的地方，歡迎指正，另外如果對這個問題有更深的認(rèn)識，或有其他解決方法，也歡迎溝通交流，期待ing????

升級xcode8后，提示一堆file missing警告
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解決Xcode刪除文件后missing file警告