什么是共線性(synteny)或同線性(colinearity)?

你需要知道:

基因組( Genome):指生物體所有遺傳物質(zhì)的總和。這些遺傳物質(zhì)包括DNA或RNA(病毒RNA)?;蚪M包括編碼DNA和非編碼DNA、線粒體DNA和葉綠體DNA。

數(shù)量性狀位點(diǎn)(QTL):就是一個性狀由多個基因決定,每個基因?qū)Υ诵誀疃际俏⑿У摹?/p>

人-鼠基因組的共線性

? ? ? ? 植物基因組在染色體大小和數(shù)目上差異很大,在一些十字花科植物如擬南芥,只不過 100 Mb差異,而在百合屬中竟高達(dá) 100000 Mb 。但是基因的數(shù)目和類型并沒有這樣明顯的差別。不同植物基因組之間大小差異是由于基因組內(nèi)存在重復(fù) DNA 的緣故(多倍性這是一種原因)。

? ? ? ? 在植物進(jìn)化過程中,基因組大小變化是一種相對頻繁的事件,但這些變化并不與基因多少及順序變化相關(guān)聯(lián)。基因數(shù)量及順序的保守性稱為同線性(colinearity),近來文獻(xiàn)中越來越多地用共線性(synteny)描述同線性(colinearity)和同源性(homeology)。共線性或同線性是一種令個驚奇的現(xiàn)象,擬南芥(雙子葉植物)和水稻(單子葉植物)是由 2 億年前的共同祖先分枝進(jìn)化而來的,但兩個物種仍可檢測到盡管比較低的共線性。

? ? ? ? 當(dāng)不同禾本科植物基因組進(jìn)行對齊和比較時,這種共線性就更加明顯而有用。比如在玉米中鑒定到的重要農(nóng)藝性狀如顆粒重、抗蟲性等性狀,也與水稻的基因組序列相關(guān)。這使得鑒定這些性狀的基因變得容易。 因?yàn)樗净蚪M草圖已經(jīng)完成, 許多數(shù)量性狀位點(diǎn) (quantitative-traitloci,QTLs)也已經(jīng)定位在水稻基因組圖譜上。

援引自 新浪博客

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