學(xué)習(xí)小組Day7筆記-zkh

測(cè)序

Sanger測(cè)序

ddNTP
測(cè)序讀長長(1000bp),準(zhǔn)確
通量低

二代測(cè)序 PE(Pair End雙端)

邊合成變測(cè)序(sequence by synthesis, SBS)

  • DNA文庫構(gòu)建
  • 橋式PCR
  • 測(cè)序
  • 數(shù)據(jù)產(chǎn)出
    高通量,讀長短,錯(cuò)誤率高

三代測(cè)序

  • PacBio 實(shí)時(shí)單分子測(cè)序
  • 復(fù)合探針-錨定連接技術(shù)
  • 納米孔單分子通道技術(shù)
  • Ion Torrent電子流檢測(cè)技術(shù)


    測(cè)序.png

1.基因組學(xué)(核酸序列分析)

(1)全基因組測(cè)序(WGS)
(2)全外顯子組測(cè)序(WES)
(3)簡(jiǎn)化基因組測(cè)序(RRGS)
①RAD-Seq
②GBS
③2bRAD
④ddGBS(也就是ddRAD)

2.轉(zhuǎn)錄組學(xué)(基因表達(dá)分析)

(1)mRNA-Seq
(2)IncRNA-Seq(長鏈非編碼RNA)
(3)sRNA-Seq(主要是miRNA-Seq)

3.蛋白質(zhì)組學(xué)

(1)蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)處理、蛋白及其修飾鑒定
(2)構(gòu)建蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫、相關(guān)軟件的開發(fā)和應(yīng)用
(3)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)功能預(yù)測(cè)
(4)蛋白質(zhì)連鎖圖

4.代謝組學(xué)

(1)代謝物指紋分析
(2)代謝輪廓分析


組學(xué).png
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