安裝monocle2 加載時(shí)報(bào)錯(cuò) object ‘clusterApply’ is not exported by 'namespace:BiocGenerics'

一開始使用conda 安裝

安裝方法：

Bioconductor Monocle :: Anaconda.org

但是會(huì)報(bào)錯(cuò)，說有沖突的包

于是我換了個(gè)code?

conda install -c? conda-forge ?bioconductor-monocle

安裝成功

但是在R里加載會(huì)出現(xiàn) ERROR :object ‘clusterApply’ is not exported by 'namespace:BiocGenerics'


解決辦法：

移除conda 安裝的包

conda remove bioconductor-monocle

根據(jù)官網(wǎng)安裝方法，進(jìn)入R里安裝

if (!require("BiocManager", quietly = TRUE))

? ? install.packages("BiocManager")

BiocManager::install("monocle")


新出現(xiàn)的bug ：

ERROR: dependencies ‘fastICA’, ‘qlcMatrix’, ‘slam’, ‘biocViews’ are not available for package ‘monocle’


解決辦法：

用conda 安裝上面的依賴包后，再用BiocManager安裝

(DONE)

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