R語(yǔ)言基礎(chǔ)

認(rèn)識(shí)R和Rstidio

R是一種免費(fèi)開源的編程語(yǔ)言，對(duì)于生信分析十分友好，因?yàn)樗鼌R集了很多函數(shù)，很多包，能夠大部分的下游分析，統(tǒng)計(jì)計(jì)算，繪圖。
Rstudio 是一款R語(yǔ)言的IDE,因?yàn)楸旧鞷自帶的環(huán)境對(duì)于操作者來(lái)說(shuō)不太友好，Rstudio提供了很多調(diào)試，可視化的功能與環(huán)境，使R的使用更為方便。

基礎(chǔ)設(shè)置

打開Rstutio后，點(diǎn)擊Tools--global options，在general中可以設(shè)置默認(rèn)的R版本，appearance里可以設(shè)置字體大小，主題等，有興趣的可以每個(gè)選項(xiàng)都嘗試一下。

R語(yǔ)言基本操作

1.設(shè)置工作目錄

設(shè)置好工作目錄，可以將腳本、文件、圖片等都保存到該目錄中，防止找不到。

getwd()  #查看當(dāng)前工作目錄
setwd(新地址) #設(shè)置新的工作目錄

或者每次新建project時(shí)，設(shè)置好名稱和位置，以后每次打開都直接打開這個(gè)project即可。

2.顯示文件列表

dir() #查看當(dāng)前工作目錄里的文件，類似于linux中的ls

3.賦值

<-是賦值，例如

x<-3 #將3賦值給x

4.刪除變量

rm(變量名)
rm（list=ls()）#刪除所有變量