網(wǎng)站主頁

國家基因庫生命大數(shù)據(jù)平臺（CNGBdb）是一個為科研社區(qū)提供生物大數(shù)據(jù)共享和應(yīng)用服務(wù)的統(tǒng)一平臺。本質(zhì)是我國組建的一個類似于NCBI存儲分子數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)庫。前身是深圳華大生命科學(xué)研究院（原深圳華大基因研究院）的深圳國家基因庫。2018年10月在深圳召開第十三屆國際基因組學(xué)大會（“ICG-13”），開幕式上深圳國家基因庫正式發(fā)布了“國家基因庫生命大數(shù)據(jù)平臺（CNGBdb）”。

該數(shù)據(jù)庫為面向世界的開放平臺，但擁有全中文界面（可以設(shè)置為英文），對初學(xué)者較為友好。

網(wǎng)站資源

平臺資源包括文獻(xiàn)、基因、變異等十類。目前樣本庫與組裝庫較為好用。在這兩個庫中可以將上傳至本庫與NCBI的數(shù)據(jù)過濾開，而在基因、序列等庫中，基本是接入NCBI或INSDC，若有直接上傳的也沒有過濾的通道，這就導(dǎo)致若用戶上傳raw數(shù)據(jù)至實驗庫，或分子標(biāo)記至序列庫就將與NCBI的數(shù)據(jù)混淆起來。解決方法是在樣本庫中輸入感興趣的研究對象（Organism），能找到相關(guān)研究的項目編號、樣本編號、實驗編號、測序信息、原始數(shù)據(jù)（fastq文件）及對應(yīng)的超鏈接，組裝庫中可以搜索到注釋了的全基因組。這樣基本能獲取CNGB的獨家資源。但望日后其他庫也能多一些過濾或檢索條件，以便更快捷的從這一國內(nèi)生物信息巨制中獲取有用數(shù)據(jù)。

組裝庫中黃色區(qū)域是設(shè)置數(shù)據(jù)來源的filter