SYMBOL 與 ENTREZID轉(zhuǎn)換

訪問NCBI ftp 下載數(shù)據(jù)
https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/
https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/gene/DATA/

gene2ensembl，gene2accession， gene2pubmed，gene2go以及
gene_info信息文件，它們的核心連接是gene的entrez ID號(hào)

人類的：
https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/gene/DATA/GENE_INFO/Mammalia/Homo_sapiens.gene_info.gz

最主要的前幾列

#tax_id     #物種編號(hào)9606 是人類
#GeneID  基因ID 最新的；所以用舊的ID 無(wú)法轉(zhuǎn)換，可以嘗試參考中方法或者爬蟲
#Symbol   基因名
#LocusTag   別名

#tax_id GeneID  Symbol  LocusTag
9606    1       A1BG    -       A1B|ABG|GAB|HYST2477

參考：
NCBI的基因entrez ID相關(guān)文件介紹
基因 ID 和 Symbol 轉(zhuǎn)換

最后編輯于 ：
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