關(guān)于全玻片掃描軟件的使用教程
1.打開(kāi)并新建一個(gè)工程

打開(kāi)后的界面

新建一個(gè)project
創(chuàng)建一個(gè)新的工程文件將需要選擇一個(gè)儲(chǔ)存位置,一般新建一個(gè)空的文件夾,在這個(gè)文件夾中將會(huì)有下面這些文件,其中project.qpproj就是我們的工程文件,下次打開(kāi)只需要將這個(gè)文件拖進(jìn)軟件即可打開(kāi)導(dǎo)入進(jìn)去的圖片。

工程文件夾
2.加入圖片

按順序添加圖片

選擇圖片類(lèi)型并導(dǎo)入
3.查看圖片并選擇感興趣的區(qū)域
雙擊點(diǎn)開(kāi)想要查看的圖片,并且選擇圖片類(lèi)型——熒光

打開(kāi)圖片
設(shè)置圖片的強(qiáng)弱參數(shù)
①點(diǎn)擊太陽(yáng)圖片標(biāo)調(diào)出各個(gè)通道的調(diào)節(jié)參數(shù)
②點(diǎn)擊顏色方塊切換到每個(gè)通道對(duì)應(yīng)的顏色
③調(diào)節(jié)Channel min 和Channel max的值來(lái)讓每一個(gè)通道的顏色深淺合適,也可以點(diǎn)擊后方的數(shù)字直接輸入數(shù)值來(lái)改變強(qiáng)弱。
④設(shè)置完成后可以點(diǎn)擊setting后面的Save鍵,將此通道的設(shè)置條件保存一下,后續(xù)就可以在setting里面下拉選擇設(shè)置好的條件。

調(diào)整參數(shù)
4.圈出感興趣的區(qū)域(ROI)
根據(jù)需要選擇不同的工具,這里使用Polygon來(lái)畫(huà)圈,點(diǎn)擊鼠標(biāo)左邊即可獲得一個(gè)頂點(diǎn),雙擊結(jié)束畫(huà)圈。

選擇ROI
為選中的ROI命名:

命名ROI
5.依據(jù)DAPI細(xì)胞數(shù)目自動(dòng)計(jì)算

cell detection

參數(shù)設(shè)置

顯示分割結(jié)果
5.機(jī)器自動(dòng)學(xué)習(xí)細(xì)胞分類(lèi)

訓(xùn)練insulin陽(yáng)性和glucagon陽(yáng)性細(xì)胞

訓(xùn)練其他細(xì)胞




結(jié)果查看
6.導(dǎo)出數(shù)據(jù)

