R包

R包.png

1.鏡像配置

高級模式
 file.edit('~/.Rprofile')
添加：
options("repos" = c(CRAN="[https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/](https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/)"))
options(BioC_mirror="[https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/](https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/)") 
保存，重啟Rstudio
再運行：options()$repos和options()$BioC_mirror 就已經配置好了

鏡像.png

2.安裝加載三部曲

options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) 
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") 
install.packages("dplyr")  #安裝包存在CRAN用這個
BiocManager::install(“dplyr”) #安裝包存在Biocductor用這個
library(dplyr)   #或者require(包)

3.dplyr五個基礎函數(shù)

1.mutate(),新增列

mutate.png

2.select(),按列篩選

(1)按列號篩選
舉個例子

select.png

(2)按列名篩選
舉個例子

select2.png

3.filter()篩選行

filter.png

4.arrange(),按某1列或某幾列對整個表格進行排序

舉個例子

arrange.png

PS：desc是降序排列（即從大到小排列）

5.summarise()：匯總

舉個例子

summaries.png

4.dplyr兩個實用技能

管道操作 %>% (cmd/ctr + shift + M)

加載任意一個tidyverse包即可用管道符號

管道.png

count統(tǒng)計某列的unique值

count.png

5. dplyr處理關系數(shù)據

1.內連inner_join,取交集

inner.png

2.左連left_join

left.png

3.全連full_join

full.png

4.半連接：返回能夠與y表匹配的x表所有記錄semi_join

semi.png

5.反連接：返回無法與y表匹配的x表的所記錄anti_join

anti.png

6.簡單合并

bind_rows()   #函數(shù)需要兩個表格列數(shù)相同
bind_cols()   #函數(shù)則需要兩個數(shù)據框有相同的行數(shù)

舉個例子

bind.png

總結

安裝包時出現(xiàn)了問題，很蠢的問題，被一起學習的小伙伴提醒，瞬間找到問題所在，感謝小伙伴！學到點點R包的基礎，感覺也很有用，加油學習！