Seurat24節(jié)氣之19立冬---meta.data

立冬:冬季的開(kāi)始。

質(zhì)量控制指標(biāo)存儲(chǔ)在Seurat中的什么位置?

  • 獨(dú)特基因的數(shù)量和總分子在計(jì)算過(guò)程中自動(dòng)計(jì)算 [CreateSeuratObject()](https://satijalab.org/seurat/reference/CreateSeuratObject.html)
    • 可以找到它們存儲(chǔ)在對(duì)象元數(shù)據(jù)中
# Show QC metrics for the first 5 cells
head(pbmc@meta.data, 5)
##                  orig.ident nCount_RNA nFeature_RNA percent.mt
## AAACATACAACCAC-1     pbmc3k       2419          779  3.0177759
## AAACATTGAGCTAC-1     pbmc3k       4903         1352  3.7935958
## AAACATTGATCAGC-1     pbmc3k       3147         1129  0.8897363
## AAACCGTGCTTCCG-1     pbmc3k       2639          960  1.7430845
## AAACCGTGTATGCG-1     pbmc3k        980          521  1.2244898
```</slot>
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