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EnhancerAtlas結(jié)合三種高通量數(shù)據(jù)的分析結(jié)果來預(yù)測人和小鼠中的增強(qiáng)子，該數(shù)據(jù)庫最新版本為v2.0, 網(wǎng)址如下

http://www.enhanceratlas.org/index2.php

對于人類增強(qiáng)子，基于hg19基因組版本進(jìn)行預(yù)測，目前包含來自170種細(xì)胞或組織共共4,506,217個增強(qiáng)子信息；對于小鼠增強(qiáng)子，基于mm9基因組版本進(jìn)行預(yù)測，目前包含來自150種細(xì)胞或組織共2,811,699個增強(qiáng)子信息。

支持直接輸入基因名稱或者基因組特定區(qū)域，查看在該區(qū)域內(nèi)的增強(qiáng)子，示意如下

檢索結(jié)果示意如下

采用了基因組瀏覽器的展示形式，每一行稱之為track, 黑色字體對應(yīng)行表示每種方法檢測到的該區(qū)域reads覆蓋結(jié)果，紅色字體對應(yīng)行為綜合多種方法得到的增強(qiáng)子區(qū)域的結(jié)果。

在結(jié)果頁面，可以下載該區(qū)域包含的增強(qiáng)子的fasta序列文件，示意如下

也可以比較增強(qiáng)子在不同細(xì)胞系中的表達(dá)，檢索框示意如下

檢索結(jié)果示意如下

可以直觀比較不同細(xì)胞系中增強(qiáng)子的表達(dá)情況。該數(shù)據(jù)庫還支持展示增強(qiáng)子和基因之間的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，檢索框示意如下

調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的結(jié)果如下所示

除了在線檢索功能外，該數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)還可以免費(fèi)下載，無論是不同細(xì)胞系中增強(qiáng)子區(qū)間，還是增強(qiáng)子和基因間的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，都可以直接下載得到。對于增強(qiáng)子研究而言，該數(shù)據(jù)庫非常值得參考。

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