關(guān)于circRNA，科研汪們都不陌生，而關(guān)于circRNA我們知道最多的則是其在轉(zhuǎn)錄和基因表達(dá)調(diào)控方面起著舉足輕重的作用，而今年國(guó)自然科學(xué)基金獲批的與circRNA有關(guān)的項(xiàng)目也達(dá)到了164項(xiàng)，所以，不蹭國(guó)自然的熱點(diǎn)怎么行。
之前我們已經(jīng)寫過兩篇文章來介紹關(guān)于circRNA的研究思路，這里我們放上鏈接，感興趣的同學(xué)可以自行打開閱讀或留言：
5分文章有多難？circRNA表示無壓力???
聽說你對(duì)circRNA感興趣？不妨進(jìn)來看看？???
而近幾年，越來越多的研究發(fā)現(xiàn)circRNA還具有編碼功能，那今天我們就來介紹第三種circRNA的研究思路，即具有編碼功能的circRNA的研究思路是怎樣開展。
今天介紹的這篇文章發(fā)表在《JNCI-Journal of the National Cancer Institute》（JNCI-J NATL CANCER I）期刊上，影響因子11.238，此期刊的舊名字為《J NATL CANCER I》，目前被最新的JCR期刊引證報(bào)告收錄。
我們來看該文章的內(nèi)容：
1.?首先作者對(duì)來自臨床膠質(zhì)母細(xì)胞瘤組織及其配對(duì)相鄰正常組織的核糖體總RNA進(jìn)行RNA-seq分析，建立一個(gè)circRNA譜數(shù)據(jù)庫，篩選出在癌癥組織和正常組織中差異表達(dá)的基因，最后確定由FBXW7(RPKM=9.31)基因的外顯子3和外顯子4環(huán)化形成的_circ_022705作為研究人員的研究對(duì)象；
2.?采用PCR和Sanger測(cè)序技術(shù)對(duì)篩選出的目標(biāo)circRNA進(jìn)行鑒定；
3.?接下來作者分析了circ-FBXW7中假定的開放閱讀框，對(duì)circ-FBXW7的編碼能力做一個(gè)評(píng)價(jià)，證明circ-FBXW7可翻譯蛋白質(zhì)。
4.?對(duì)circ-FBXW7編碼的蛋白質(zhì)進(jìn)行細(xì)胞功能驗(yàn)證：作者構(gòu)建了線性FBXW7-FLAG載體來建立穩(wěn)定高表達(dá)U251和U373細(xì)胞的FBXW7-185aa，之后檢測(cè)細(xì)胞周期和細(xì)胞增殖，結(jié)果表明，F(xiàn)BXW7-185aa可以引起細(xì)胞周期阻滯，減少膠質(zhì)瘤細(xì)胞的增殖。
5.?之后作者對(duì)circ-FBXW7翻譯蛋白質(zhì)的分子機(jī)制進(jìn)行了探討：有證據(jù)闡明FBXW7-185aa與USP28和“釋放”FBXW7α競(jìng)爭(zhēng)性相互作用來降解c-Myc；
6.?最后為了討論circ-FBXW7和FBXW-185aa的臨床意義，作者又檢測(cè)了腫瘤患者體內(nèi)的癌變組織和癌旁正常組織中的FBXW7-185aa和circ-FBXW7表達(dá)。
文章的研究思路大致就是這樣，現(xiàn)在我們總結(jié)一下：作者首先運(yùn)用生信分析的方法篩選出感興趣的circRNA，然后對(duì)此circRNA進(jìn)行鑒定，之后對(duì)其編碼能力做鑒定，證明其可翻譯成蛋白質(zhì)，證明完后，作者又對(duì)其翻譯的蛋白質(zhì)進(jìn)行了生物學(xué)功能驗(yàn)證，之后對(duì)它作用的分子機(jī)制進(jìn)行探討，最后進(jìn)行體內(nèi)實(shí)驗(yàn)，檢測(cè)臨床標(biāo)本來說明臨床意義。
科研汪們有沒有g(shù)et到這個(gè)新思路呢，目前關(guān)于circRNA研究的主流方向是之前我們介紹過的兩種思路，而在該方向的研究報(bào)道還較少，正因?yàn)楸容^新穎，所以會(huì)不會(huì)對(duì)你們有什么啟發(fā)呢？
或者大家有什么別的想法，歡迎在評(píng)論區(qū)留言，我們一起來探討~
參考文獻(xiàn)（圖片來自文獻(xiàn)）：
Yang?Y,?Gao?X,?Zhang?M,?et?al.?Novel?Role?of?FBXW7?Circular?RNA?in?Repressing?Glioma?Tumorigenesis.[J].?Journal?of?the?National?Cancer?Institute,?2018,?110(3).?
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