沒(méi)想到是以這種方式開(kāi)啟星球之旅,相信堅(jiān)持下去定會(huì)有收獲!
最近關(guān)注了一下單細(xì)胞相關(guān)數(shù)據(jù)挖掘及數(shù)據(jù)分析,鑒于自身基礎(chǔ)薄弱,就從 簡(jiǎn)書(shū) 劉小澤 單細(xì)胞交響樂(lè) 學(xué)習(xí)筆記(http://www.itdecent.cn/p/aa0a4306b067)開(kāi)始,也感謝其對(duì)原著的分享(https://bioconductor.org/books/release/OSCA/)!
單細(xì)胞數(shù)據(jù)挖掘
引自生信星球之單細(xì)胞交響樂(lè)學(xué)習(xí)筆記01
單細(xì)胞交響樂(lè)學(xué)習(xí)筆記01——數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)SingleCellExperiment.png
附:創(chuàng)建矩陣的代碼(引自生信星球)
counts_matrix <- data.frame(cell_1 = rpois(10, 10),
cell_2 = rpois(10, 10),
cell_3 = rpois(10, 30))
rownames(counts_matrix) <- paste0("gene_", 1:10)
counts_matrix <- as.matrix(counts_matrix)
小結(jié)
第一次在簡(jiǎn)書(shū)更作業(yè),內(nèi)容多轉(zhuǎn)自生信星球 劉小澤,希望能多多學(xué)習(xí)他們的文章,給自己加個(gè)油!
