今天學(xué)習(xí)的內(nèi)容是R和Rstudio的安裝，以及R的基礎(chǔ)操作。學(xué)習(xí)資源主要有：

1. 當(dāng)Rstudio杠上中文用戶名
2. 給自己一個(gè)全新的R語(yǔ)言環(huán)境

一、認(rèn)識(shí)R與Rstudio

• R：一種編程語(yǔ)言，匯集了許多函數(shù)，能夠提供統(tǒng)計(jì)、繪圖等強(qiáng)大功能。
• Rstudio：R語(yǔ)言軟件界面簡(jiǎn)陋，圖形界面的Rstudio能夠使R更方便使用。RStudio是免費(fèi)提供的開(kāi)源集成開(kāi)發(fā)環(huán)境（IDE）。

二、安裝R與Rstudio

我的電腦之前已經(jīng)安裝了這兩個(gè)軟件，為了學(xué)習(xí)的完整性，還是要梳理一下整個(gè)安裝的過(guò)程。并且，安裝會(huì)涉及用戶名中英文的問(wèn)題，我在首次安裝的時(shí)候沒(méi)有遇到，這次記錄了如果用戶名是英文，該怎么修改的方法。

1. 查看電腦用戶名是中文還是英文

查看任意一個(gè)桌面文件的路徑，Desktop的上一級(jí)就是用戶名。

2. 修改用戶名

如果用戶名是中文，則需要修改
電腦搜索欄 - 控制面板 - 環(huán)境變量 - 修改TEMP、TMP為不帶中文的路徑 - 重啟電腦

注：所有自己的重要文件要云備份：堅(jiān)果云、iCloud云盤(pán)都是非常好的雙向同步云

3.下載R與Rstudio

Rstudio界面.png

三、Rstudio基本操作

1. 設(shè)置字體大小

Tools - Global Options - Appearance

2. 用Rproject管理工作目錄

新建project - New Directory - New project - 設(shè)置文件名、路徑 - 在文件夾里打開(kāi)project

3. 顯示文件列表

getwd：顯示當(dāng)前路徑
setwd：設(shè)置當(dāng)前路徑，注意，直接復(fù)制電腦的路徑過(guò)來(lái)，要把/改為\，否則識(shí)別不了
dir()、list.files()：顯示當(dāng)前路徑有哪些文件

4.數(shù)學(xué)運(yùn)算

加：a+b
減：a-b
乘：a*b
除：a/b
平方：a^b
開(kāi)方：sqrt()
求絕對(duì)值：abs()
取對(duì)數(shù)：loga(b)

5. 賦值

用<-或->賦值，箭頭指向?qū)ο?，Alt+-可以打出。例如：x <-5

6. 刪除

刪除對(duì)象：rm()
刪除所有變量：rm(list = ls())

7. 歷史命令

history()

8. 清空控制臺(tái)

Ctrl+l

四、嘗試做幾個(gè)圖

1. plot()函數(shù)
   詳情參考：

• R語(yǔ)言基礎(chǔ)備忘-plot()詳解
• 聽(tīng)說(shuō)你還不會(huì) plot 函數(shù)？ (這個(gè)鏈接講得很好理解)

plot()函數(shù)是基礎(chǔ) R 包 graphics 里的函數(shù)，對(duì)于繪制一些簡(jiǎn)單基礎(chǔ)的圖形完全可以，想要繪制復(fù)雜一點(diǎn)的也是完全可以。

圖源：微信公眾號(hào)老俊俊的生信筆記

圖源：微信公眾號(hào)老俊俊的生信筆記

做一個(gè)圖試試：代碼如下

a<-c(1:5)
b<-c(2:6)
plot(a,b,type = "p",main="圖1",xlab="橫軸",ylab="縱軸",col="red")

定義變量a為1到5的整數(shù)，定義變量b為2到6的整數(shù)，圖的類型是點(diǎn)圖，標(biāo)題為“圖1”，橫軸標(biāo)注為“橫軸”，縱軸標(biāo)注為“縱軸”，圖形顏色是紅色。

圖1

2. rnorm()函數(shù)
   rnorm(n, mean = 0, sd = 1)
   n 為產(chǎn)生隨機(jī)值個(gè)數(shù)（長(zhǎng)度），mean 是平均數(shù)， sd 是標(biāo)準(zhǔn)差 ,rnorm() 函數(shù)呈隨機(jī)正態(tài)分布，隨機(jī)抽樣或者取值 n 次。
   plot(rnorm(10,5,1))的圖像如下：
   

   圖2

3. runif()函數(shù)
   runif()和rnorm()都是用于隨機(jī)生成數(shù)值的函數(shù)，但是有區(qū)別。注意對(duì)比兩者圖像的差異。
   runif(n, min = 0, max = 1)
   n為產(chǎn)生隨機(jī)值的個(gè)數(shù)，min為最小值，max為最大值。
   plot(runif(10,1,5))的圖像如下：
   

   圖3.PNG

4. boxplot()函數(shù)
   boxplot()用于繪制箱線圖?？山o出變量的中心趨勢(shì)，發(fā)散情況和離群值。
   箱子中間的線代表中位數(shù)，表示平均水平；箱子上下兩條邊分別代表第三、第一個(gè)四分位數(shù)，箱子的長(zhǎng)度可反應(yīng)數(shù)據(jù)的離散情況；箱子外的上下兩條線代表最大最小值，線外的點(diǎn)可能為離群值。
   boxplot(iris$Sepal.Length~iris$Species,col = c("lightblue","lightyellow","lightpink"))
   表示繪制一個(gè)箱線圖，呈現(xiàn)不同種類鳶尾花的花萼長(zhǎng)度的統(tǒng)計(jì)情況，箱子的顏色分別為淺藍(lán)，淺黃，淺粉。
   

   圖4
   
   注：iris是一個(gè)R語(yǔ)言自帶的數(shù)據(jù)框，通常用作示例。iris$Sepal.Length表示iris數(shù)據(jù)框的Sepal.Length這一列數(shù)據(jù)。以此類推。

Day4思維導(dǎo)圖