由QTL到基因--到底該不該高興呢？
同源克隆的話題我們討論了不少（
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）。也曾說過，如果要圖位克隆一個QTL，請事先確定區(qū)間內(nèi)沒有已報道的與要做的性狀相關的基因，如果有，就要首先確定性狀是不是由該基因控制，當然，沒有最好了。今天我們來說一說GW2這個基因，GW2這個基因首先在水稻里被圖位克隆，該基因控制水稻粒寬、粒重并對籽粒灌漿速率也有正向效應。而在小麥里TaGW2更是被報道了不下七八次，下面列一下與TaGW2直接相關的研究論文，有興趣的可以查閱原文閱讀。
1、Identification and development of a functional marker of TaGW2 associated with grain weight in bread wheat (Triticum aestivum L.)
2、Homologous haplotypes, expression, genetic effects and geographic distribution of the wheat yield gene TaGW2
3、Identification of Novel SNP in Promoter Sequence of TaGW2-6A Associated with Grain Weight and Other Agronomic Traits in Wheat (Triticum aestivum L.)
4、Down-regulation of the TaGW2 gene by RNA interference results in decreased grain size and weight in wheat
5、Function of TaGW2-6A and its effect on grain weight in wheat (Triticum aestivum L.)
6、TaGW2-6A allelic variation contributes to grain size possibly by regulating the expression of cytokinins and starch-related genes in wheat
7、Influence of TaGW2-6A on seed development in wheat by negatively regulating gibberellin synthesis
8、TaGW2, a Good Reflection of Wheat Polyploidization and Evolution
9、A splice acceptor site mutation in TaGW2-A1 increases thousand grain weight in tetraploid and hexaploid wheat through wider and longer grains
10、A mutation in TaGW2-A increases thousand grain weight in wheat
11、Analyse fonctionnelle de TaGW2, une E3 ligase de type RING, dans le développement du grain de blé tendre (Triticum aestivum)
12、Transcript suppression of TaGW2 increased grain width and weight in bread wheat
13、SNP identification and allelic-specific PCR markers development for TaGW2, a gene linked to wheat kernel weight.
這13篇論文我只看過一部分，有些是剛搜出來的，看題目的話，感覺第6和第7篇文獻貌似套路差不多啊。
說回今天要推薦的文章上，今天要推薦的文章發(fā)表在TAG上，文章的題目是“A novel allele of TaGW2-A1 is located in a finely mapped QTL that increases grain weight but decreases grain number in wheat (Triticum aestivum L.)”，通訊作者是中國農(nóng)大的倪中福教授，第一作者是翟會杰。
先插一句
，我看著TAG的排版貌似變了，摘要部分不再是左右兩欄了。
本文主要對粒重和穗粒數(shù)進行了研究。首先利用包含191個家系的RIL群體，獲得了11組田間表型數(shù)據(jù)，結合圖譜上的10,816個SNP和SSR標記進行QTL掃描，最終鑒定出5個基因組區(qū)段（QTL）與粒重或穗粒數(shù)有關，分別位于1B,3A,3B,5B以，6A以及7A。其中6A上的QTL既影響粒重也影響穗粒數(shù)，使用近等基因系該QTL被定位在長0.538cM的區(qū)間內(nèi)，效應評價表明該位點在優(yōu)異近等基因系里能增加千粒重8.33%，但穗粒數(shù)減少了3.05%。在該區(qū)間內(nèi)有一個已報道的基因TaGW2，所以接下來就在兩個材料里克隆該基因，發(fā)現(xiàn)粒重高的材料在基因的5'端有114bp的缺失，該缺失能夠影響啟動子活性繼而下調基因表達。對848份普通小麥檢測發(fā)現(xiàn)只有3份材料缺失114bp，分別是Jinan 13, Jinghua 9和Gaoyou 0551。
聽說這篇文章審稿的時候還挺曲折的
。穗粒數(shù)或粒重到底與GW2有沒有關系還是需要進一步的研究來確定，這么多文章下來，有些結論還是沖突的，有的文章里報道是正調控，有的是負調控，還是需要進一步的研究來闡明背后的調控機制。
這篇文章在材料與分析方法以及寫作方面都有值得借鑒的地方，有時間可以精讀。
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