ubuntu相關(guān)

1. chmod的用途，場景
2. scp的作用
3. 環(huán)境變量的用途？怎么添加？
4. ~/.bashrc是什么文件
5. 命令行下的~ . / \ |分別有什么含義，是什么的縮寫
6. ubuntu的文件系統(tǒng)的由深到淺，簡單講一下。一般執(zhí)行程序在哪，用戶在哪。
7. 命令行下的文檔編輯軟件和文檔閱讀軟件有哪些？簡單講一下怎么用？
8. 怎么統(tǒng)計一個文件的行數(shù)
9. 怎么后臺一個程序，怎么后臺一個運行中的程序。能否關(guān)閉命令行？
10. 怎么提升用戶權(quán)限
11. 怎么安裝R包
12. 怎么添加用戶，useradd和adduser區(qū)別？
13. ln是什么
14. 如何在服務(wù)器上使用有圖形界面的軟件
15. 需要編譯的軟件的安裝步驟是什么
16. 如果沒有管理員權(quán)限，你怎么安裝軟件
17. R、python如何查看源代碼
18. > >> 2>&1這三個分別是什么含義，有什么區(qū)別
19. stdout是什么，還有兩個同類的是什么
20. 如何在無圖形界面的服務(wù)器上看圖片
21. ./script.py和. ~/.bashrc的第一個句號含義一樣嗎？
22. ubuntu的文件系統(tǒng)的構(gòu)造大致是如何的，/、/home/、/usr/bin、/etc/分別都是放什么的
23. ubuntu文件系統(tǒng)中常出現(xiàn)的bin是什么，跟windows的bin一樣嗎
24. 如何給apt換源，源是什么。
25. apt與dpkg的關(guān)系是什么
26. 錯誤的給環(huán)境變量添加了一個目錄，如何刪除。
27. export PATH=/home/xx/miniconda/bin:$PATH，這句命令有沒有錯，可能會出什么問題
28. 如何安全地使用sftp與非服務(wù)器用戶交流傳輸文件。
29. 安裝軟件中，make ; ./configure分別是什么意思
30. git和其它vcs（Version control system）的最大不同在哪

人類基因組學(xué)

1. sam bam是什么
2. 簡單講一下能夠處理sam相關(guān)的工具
3. alignment是什么，assembly是什么，什么時候用什么
4. 簡單說說二代測序原理
5. vcf bcf是什么
6. fastq和fasta的區(qū)別
7. quality是什么，有幾種
8. ref 和alt的表現(xiàn)形式有多種嗎？什么情況下有
9. 不同格式的文件如vcf和sam，位置信息能通用嗎?為什么
10. 如何從一個sam里切出需要的區(qū)域，output為fasta
11. 請說出最常用的幾個數(shù)據(jù)庫（數(shù)據(jù)庫又分為很多種）

16s微生物組

1. OTU是什么，為什么要分OTU
2. rarefaction curve是什么
3. subsampling 是啥
4. chimera 是啥
5. 對OTU table篩選的意義是啥，例如otu size < 2
6. 如果分析需要做物種分布，你手頭上只有個otu table和代表序列，應(yīng)該怎么做
7. biom跟otu table的區(qū)別
8. zotu或者說ESV是什么
9. 該領(lǐng)域研究中的常規(guī)分析包含哪些。
10. OTU picking有三種策略，有de novo,close-reference, open-reference，分別是什么含義。

python

1. 如何寫一個批量腳本
2. 常用的包
3. 怎么羅列某目錄的文件·
4. 如何在python里運行其他軟件
5. 如何安裝軟件，如果pip中沒有
6. 畫圖有什么包
7. 一個terminal中執(zhí)行函數(shù)，出現(xiàn)bug但是查看函數(shù)的原代碼沒有錯誤，有什么可能性？
8. 如何在ide(ipython、pycharm)中使用或?qū)胍延械膒ython腳本
9. 字典的好處在哪，壞處
10. subsampling(重采樣)怎么實現(xiàn)
11. 如何執(zhí)行一段字符串
12. __name__ == '__main__' 是什么含義。
13. reload pandas 的意義在哪
14. list能否作為dict中的key，為什么
15. 格式化字符串的幾種方法
16. 如何制作一個不用經(jīng)常修改內(nèi)部代碼的可執(zhí)行腳本，即如何接受外部變量并使用其作為腳本的變量來使用
17. 在python2.7，使用datas = [data for data in iterator]可能會出什么問題。

R

1. 直接從read.csv讀入一個文件后，如何以某一列為遍歷用的list，來進行循環(huán)。（提示：直接寫循環(huán)是會報錯的，需要類型轉(zhuǎn)換，那么如何轉(zhuǎn)換？轉(zhuǎn)換成什么？）

python

1. import一個庫，用的多了經(jīng)常會出現(xiàn)些問題，那么從那里開始解決這些問題。

數(shù)學(xué)

1. 講一下MDS、PCA、LDA是什么· ，目的是什么？
2. subsampling是什么
3. 簡單說說HMM是什么，

數(shù)據(jù)分析