Mac中R包安裝gfortran: No such file or directory問題解決辦法

? ? ? ?這兩天在安裝兩個(gè)依賴包NNLM和leidenbase，依次出現(xiàn)了gcc和gfortran的問題，用R3.6.3和R4.2.0問題都一樣。必應(yīng)上搜了搜，才知道是Mac環(huán)境變量問題。

? ? ? ?先重裝了gcc，按照https://www.cynkra.com/blog/2021-03-16-gfortran-macos/的提示修改~/.R/Makevars，但是發(fā)現(xiàn)我的Mac中沒有這個(gè)文件“/usr/local/opt/gcc/bin/gfortran”，但有/opt/homebrew/Cellar/gcc/11.2.0_3/bin/gfortran，于是依葫蘆畫瓢將~/.R/Makevars內(nèi)容修改如下：

FC? ? = /opt/homebrew/Cellar/gcc/11.2.0_3/bin/gfortran

F77? = /opt/homebrew/Cellar/gcc/11.2.0_3/bin/gfortran

FLIBS = -L/opt/homebrew/Cellar/gcc/11.2.0_3/lib

可是還是一樣報(bào)錯(cuò)。

? ? ? ? 又重新下載gfortran、安裝，~/.R/Makevars內(nèi)容修改為：

FC? ? = /usr/local/gfortran/bin/gfortran

F77? = /usr/local/gfortran/bin/gfortran

FLIBS = -L/opt/homebrew/Cellar/gcc/11.2.0_3/lib

重啟R，安裝leidenbase包，報(bào)錯(cuò)變成了“gfortran: Permission denied”。終端運(yùn)行：sudo chmod -R 777 /usr/local/gfortran/，修改權(quán)限，再重啟R，安裝leidenbase包，順利完成。再順手把NNLM裝了，也是一路順暢！

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