根據(jù)PMID號批量下載文獻

  1. 該方法基于Python3.7實現(xiàn),需要安裝以下包:
pip3 install requests requests3 beautifulsoup4 lxml
  1. 新建文件夾作為工作空間,下載工程(無git的話去官網(wǎng)手動下載工程):
git clone git@github.com:billgreenwald/Pubmed-Batch-Download.git
  1. 工作空間下建立PMF.tsv文件,每行為一個PMID:
27547345
22610656
23858657
24998529
27859194
26991916
26742956
28388874
  1. 工作空間下建立一個后綴為”.bat”的文件,包括以下內(nèi)容(修改本地路徑):

    python.exe 本地路徑\Pubmed-Batch-Download\fetch_pdfs.py -pmf PMF.tsv
    pause
    
  2. 點擊bat文件,開始下載文獻,下載的PDF文件位于fetched_pdfs目錄下。

最后編輯于
?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請聯(lián)系作者
【社區(qū)內(nèi)容提示】社區(qū)部分內(nèi)容疑似由AI輔助生成,瀏覽時請結(jié)合常識與多方信息審慎甄別。
平臺聲明:文章內(nèi)容(如有圖片或視頻亦包括在內(nèi))由作者上傳并發(fā)布,文章內(nèi)容僅代表作者本人觀點,簡書系信息發(fā)布平臺,僅提供信息存儲服務(wù)。

相關(guān)閱讀更多精彩內(nèi)容

友情鏈接更多精彩內(nèi)容