針對目前大部分PPP項目中涉及的建設(shè)征地拆遷補償費用，一般PPP合同中僅僅約定，建設(shè)征地拆遷補償費用由項目公司承擔(dān)，后期政府通過可用性服務(wù)費予以支付。

如按照需要按照11%稅率繳納銷項稅。如出現(xiàn)此類情況，項目公司會出現(xiàn)較大虧損。

根據(jù)財稅{2016}140號文件的相關(guān)規(guī)定：房地產(chǎn)開發(fā)企業(yè)中的一般納稅人銷售其開發(fā)的房地產(chǎn)項目，以取得的全部價款和價位費用，扣除受讓土地時向政府部門支付的土地價款后的余額為銷售額。

目前未有專門稅務(wù)文件針對“PPP項目土地征地拆遷補償費用”的規(guī)定，如果符合相應(yīng)條件，可比照房地產(chǎn)開發(fā)企業(yè)，以可用性服務(wù)費抵減代替政府支付的土地征拆和安置成本后的余額為銷售額。

如想利用差額繳納增值稅，需要滿足以下條件：

1、 需要在PPP協(xié)議中約定，該項土地拆遷和安置成本支出，是指向政府、土地管理部門或受政府委托收取土地價款的單位直接支付的土地征拆和安置價款， 支付的相應(yīng)征拆費用，應(yīng)取得縣級以上財政部門開具的具有財政監(jiān)制印章的行政事業(yè)性收費依據(jù)及其他征拆證明材料。

2、在PPP協(xié)議里面約定，經(jīng)政府方認定的征地拆遷補償費用作為總投資，可在項目運營期間內(nèi)合理抵減取得的可用性服務(wù)費，并以遞減后的余額為銷售額。