文獻(xiàn)信息：
標(biāo)題：Functional and Genomic Variation between Human-Derived Isolates of Lachnospiraceae Reveals Inter- and Intra-Species Diversity
中文：人源Lachnospiraceae分離株之間的功能和基因組變異揭示了種間和種內(nèi)多樣性
雜志：cell host and microbe
時(shí)間：2020

摘要：
屬于鉤端螺旋體科的細(xì)菌在健康人類中是微生物群落中豐富的專性厭氧成員。拉氏螺菌科通過(guò)產(chǎn)生短鏈脂肪酸，將伯膽汁酸轉(zhuǎn)化為仲膽汁酸并促進(jìn)對(duì)腸道病原體的定植抗性來(lái)影響宿主。為了增進(jìn)我們對(duì)該家族成員之間基因組和功能多樣性的了解，我們培養(yǎng)了代表人類供體的11個(gè)屬和27個(gè)物種的273漆單藻科分離株，并進(jìn)行了全基因組測(cè)序組裝和注釋。這項(xiàng)分析表明，物種間和物種間的途徑存在很大差異，這很可能會(huì)影響菌株對(duì)寄主健康的影響。這些差異可能會(huì)通過(guò)羊毛硫抗生素表達(dá)或腸道酸化影響定居抗性，可能通過(guò)丁酸產(chǎn)生影響宿主粘膜免疫細(xì)胞和腸上皮細(xì)胞，或者通過(guò)異質(zhì)多糖代謝促進(jìn)財(cái)團(tuán)內(nèi)部的協(xié)同作用。這些特定功能的鑒定可以促進(jìn)益生菌菌群的發(fā)展，所述益生菌菌群驅(qū)動(dòng)和/或恢復(fù)體內(nèi)微生物組功能。

人體共生菌相對(duì)豐度

Lachnospiraceae分離株系統(tǒng)發(fā)生

核心基因比較分析多樣性