2018APT(252)-001 核酸適配體與靶標(biāo)相互作用（界面）研究進(jìn)展綜述

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2018APT(252)-001 核酸適配體與靶標(biāo)相互作用（界面）研究進(jìn)展綜述

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【推薦語】劉珍寶老師的綜述文章，結(jié)合不同的靶標(biāo)（小分子、大分子、細(xì)胞）與適配體的相互作用。介紹了研究相互作用的常用技術(shù)，兩者之間的主要相互作用力，以及結(jié)構(gòu)研究技術(shù)等。理解這些技術(shù)和相互作用的作用力，對于篩選或應(yīng)用都會有幫助。推薦閱讀。

劉珍寶 帥哥一枚

一、內(nèi)容簡介：

?文章從三個主要方面總結(jié)了適體 - 靶標(biāo)相互作用研究的進(jìn)展。首先，我們說明適配體的靶標(biāo)，包括小分子，大分子，甚至活細(xì)胞。其次，我們介紹了常用于探測相互作用的主要方法，包括傳統(tǒng)的物理化學(xué)方法和分子對接模擬。第三，適配體與靶標(biāo)相互作用的主要作用力。

適配體可以形成多種結(jié)構(gòu)形狀，例如發(fā)夾，凸起，假結(jié)和G-四鏈體。它們可通過氫鍵，靜電相互作用，疏水作用，π-π堆積，范德華力，或這些不同的力的組合與靶分子發(fā)生相互作用。

相互作用研究技術(shù)：SPR 、CD、ITC、足跡法、截短實驗、NMR & X-ray、分子對接模擬，還有一些其它的技術(shù)，如毛細(xì)管電泳，質(zhì)譜，石英晶體微量天平，熒光光譜，原子力顯微鏡，拉曼光譜，小角度X射線散射，體積和光譜測量等。

【筆記】根據(jù)適配體Rd13的CD光譜，他們推斷適體很可能折疊成G-四鏈體結(jié)構(gòu)，因為CD光譜在260nm處顯示最大值，在240nm處顯示最小值，這是G-的特征。四重結(jié)構(gòu)。在溶液中加入氯化鎂后，260nm處的信號增加，240nm處的信號減少，表明適體易于在低鹽緩沖液中形成G-四鏈體結(jié)構(gòu)。

【評述】：如果篩選小分子，與相互作用的模式可能與小分子自身結(jié)構(gòu)密切相關(guān)。分析不同的結(jié)構(gòu)，也許能采用不同的方法進(jìn)行篩選，有利于提高篩選的成功率。

二、關(guān)鍵詞：適配體 相互作用研究技術(shù) SPR ITC ?CD NMR X-ray

三、文獻(xiàn)信息：

1 Cai,?S.?et?al.?Investigations?on?the?interface?of?nucleic?acid?aptamers?and?binding?targets.? Analyst?143,?5317-5338,?doi:10.1039/c8an01467a?(2018).

四、原文鏈接

https://pubs.rsc.org/en/content/articlehtml/2018/an/c8an01467a

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