Bioperl的安裝以及使用npm安裝

2020-02-19

首先登陸上bioperl官網(wǎng)??https://metacpan.org/release/BioPerl

注:以下都是在我的env下進(jìn)行

一、Bioperl安裝

1、進(jìn)度對(duì)應(yīng)模塊兒(需要安裝的東西)界面

點(diǎn)擊側(cè)邊的install instructions,如圖1(這個(gè)是blastutils的模塊兒界面)

圖1(這個(gè)模塊兒和VFDB有關(guān))和這個(gè)鏈接的東西相關(guān) https://npm.taobao.org/package/blastutils/v/1.1.15

2、按照instructions安裝

點(diǎn)擊,出現(xiàn)以下提示,,如圖2(注意,圖2是bioperl的安裝,不是任何其他模塊兒的安裝說明)

1)

圖2(安裝bioperl)

根據(jù)圖2在我的環(huán)境下執(zhí)行這兩個(gè)命令,安裝結(jié)束后點(diǎn)擊 q 退出perl

2)

圖3(與ARDB相關(guān)bio::seqIO) http://blog.sciencenet.cn/blog-306699-1059379.html?

二、使用npm安裝

另一個(gè)shell執(zhí)行了

npm install blastutils

npm install node-tool-utils --save

參考https://npm.taobao.org/package/node-tool-utils


參考:

1、bioperl安裝(無需root權(quán)限)http://www.itdecent.cn/p/f348464c52da?(后面執(zhí)行build不存在,這個(gè)失敗

2、https://metacpan.org/release/BioPerl? (根據(jù)官網(wǎng)安裝提示直接安裝,時(shí)間較長,中間需要y

3、https://npm.taobao.org/package/node-tool-utils?(使用npm安裝的提示

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