在集群ssh software-install從ncbi下載基因組數(shù)據(jù)，用的wget --recursive --no-host-directories --cut-dirs=6 ftp://ftp.* -P ./下載到70%顯示網(wǎng)絡(luò)中斷了，已經(jīng)登出了，4月28號(hào)看還有文件夾在生成

圖1.png

圖2.png

圖3.png

求助系統(tǒng)管理后發(fā)現(xiàn)這是個(gè)大烏龍，以下是解決方法

圖4.png

• 原因：
  1. 找錯(cuò)了登錄節(jié)點(diǎn)，此時(shí)登錄節(jié)點(diǎn)應(yīng)該是安裝軟件用的節(jié)點(diǎn)ssh software-install
  2. 證明wget已經(jīng)支持?jǐn)帱c(diǎn)續(xù)傳了
• 解決辦法:
  1. 回到安裝登錄節(jié)點(diǎn)

     $ ssh software-install 
     Last login: Tue Apr 28 15:53:21 2020 from 10.54.25.20
     

  2. 查看此節(jié)點(diǎn)所有wget的任務(wù)，在該節(jié)點(diǎn)用ps ux | more也可以查看

     $ ps -ef |grep wget
     thisisme 7906     1  0 Apr26 ?        00:38:54 wget --recursive --no-host-directories --cut-dirs=6 ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/GCA/010/614/865/GCA_010614865.1_ASM1061486v1 -P ./
     thisisme 19417 19204  0 13:51 pts/16   00:00:00 grep wget
     34582    29133 31112  1 11:43 pts/45   00:01:45 wget ftp://ftp.sra.ebi.ac.uk/vol1/fastq/ERR375/ERR375744/ERR375744_2.fastq.gz
     70122    32614     1  0 Apr17 ?        01:37:53 wget -m -c ftp://dbnsfp:dbnsfp@dbnsfp.softgenetics.com/dbMTS1.0
     

  3. kill 7906完美解決

總結(jié)

建議加強(qiáng)下linux基礎(chǔ)知識(shí)，注意問(wèn)題產(chǎn)生的前后聯(lián)系，多多理解節(jié)點(diǎn)概念