轉(zhuǎn)錄組測序可以提供關(guān)于基因表達(dá)的信息，探究作物在不同環(huán)境條件下的調(diào)控過程和基因表達(dá)變化，但是如果要了解更復(fù)雜的生物調(diào)控過程，就需要借助其他組學(xué)進(jìn)行不同維度生物學(xué)數(shù)據(jù)的分析；可以借助蛋白組、代謝組，更全面的探究農(nóng)作物如何調(diào)控機(jī)體的生理和代謝過程，對于我們改良農(nóng)作物、提高農(nóng)業(yè)生產(chǎn)效率有重要作用。

本期收錄了關(guān)于轉(zhuǎn)錄組多組學(xué)技術(shù)在農(nóng)學(xué)研究中的應(yīng)用相關(guān)高分文章（一）。

1 .借助轉(zhuǎn)錄組多組學(xué)技術(shù)鑒定398種粟的種質(zhì)資源

文章標(biāo)題：Multi-omics analyses of 398 foxtail millet accessions reveal genomic regions associated with domestication, metabolite traits, and anti-inflammatory effects發(fā)表期刊：Mol Plant影響因子：21.949中科院分區(qū)：生物學(xué)一區(qū)發(fā)表時(shí)間：2022.08.01

摘要

研究者對398種粟的種質(zhì)資源進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組、代謝組、基因組的檢測，鑒定了數(shù)百種影響多種次生代謝產(chǎn)物的常見變異，觀察到不同亞群間的代謝物自然變異和遺傳結(jié)構(gòu)的差異；其中黃色顆粒的等位基因的選擇差異導(dǎo)致了不同亞群的類胡蘿卜素和內(nèi)源性激素等代謝物的差異；使用Crisper介導(dǎo)基因編輯，驗(yàn)證了八氫番茄紅素合酶1（PSY1）基因在影響小米籽粒顏色和質(zhì)量方面的功能；多組學(xué)研究證明了粟的農(nóng)業(yè)馴化如何塑造其轉(zhuǎn)錄和代謝物特征。（PMID 35808829）

2 .借助轉(zhuǎn)錄組多組學(xué)技術(shù)解析不同環(huán)境下的大麥種質(zhì)資源差異的分子機(jī)制

文章標(biāo)題：Multi-Omics Analysis Reveals the Mechanism Underlying the Edaphic Adaptation in Wild Barley at Evolution Slope (Tabigha)發(fā)表期刊：Adv Sci (Weinh)影響因子：17.521中科院分區(qū)：一區(qū)發(fā)表時(shí)間：2021.08.13

摘要

研究者對生長在紅土和玄武巖中的十種野生大麥種質(zhì)資源進(jìn)行多組學(xué)檢測（WGBS、RNA-seq、代謝組檢測），多組學(xué)分析表明，紅土上的大麥的糖代謝通路更活躍，玄武巖上的大麥的苯丙烷/酚酰胺生物合成通路更活躍；本研究結(jié)果對野生大麥的生態(tài)適應(yīng)有了深刻的見解，為開發(fā)具有高非生物脅迫耐受性的大麥提供了優(yōu)良的遺傳和表觀遺傳資源。（PMID 34390227）

3 .借助轉(zhuǎn)錄組多組學(xué)技術(shù)解析兩個(gè)品種水稻種子活力調(diào)節(jié)模塊

文章標(biāo)題：A multiomic study uncovers a bZIP23-PER1A-mediated detoxification pathway to enhance seed vigor in rice發(fā)表期刊：Proc Natl Acad Sci U S A影響因子：12.779中科院分區(qū)：綜合性期刊一區(qū)發(fā)表時(shí)間：2022.03.01

摘要

研究者對兩個(gè)水稻品種（Kasalath和Jigeng88）進(jìn)行多組學(xué)檢測（轉(zhuǎn)錄組&代謝組），研究兩個(gè)品種在不同逆境環(huán)境下的種子活力差異，借助轉(zhuǎn)錄組和代謝組數(shù)據(jù)的聯(lián)合，證明了調(diào)控水稻種子活力的調(diào)節(jié)模塊（bZIP23-PER1A）通過脫落酸信號(hào)通路運(yùn)行。（PMID：35217598）。

以上3篇是第一期轉(zhuǎn)錄組多組學(xué)技術(shù)在農(nóng)學(xué)研究中的應(yīng)用相關(guān)高分文章，后期會(huì)有更多高分文獻(xiàn)速遞~

敬請期待?。?！