2018-10-11科研整體思維邏輯整理

目錄

一 科研的五大恒量

二 科研的三大變量

三 變量和恒量的搭配

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恒量1-疾病

醫(yī)學(xué)科研,多數(shù)離不開(kāi)對(duì)疾病的攻克,一切都是以此為導(dǎo)向。當(dāng)然除了部分大牛,也有可能就是為了探索未知的自然科學(xué)問(wèn)題,(這句話來(lái)自某某諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)獲得者本身的傳奇經(jīng)歷)

恒量2-表型

我們來(lái)說(shuō)說(shuō)常規(guī)而不是例外,既然是疾病,就會(huì)有它自己的某些特征,也就是我們說(shuō)的疾病的表型(一直對(duì)表型的理解不是很透徹,此處引用一句話叫做表型是描述疾病發(fā)展的病理生理過(guò)程,其實(shí)也可以從字面意思去理解,表:表現(xiàn);型:類型,特征;就是疾病表現(xiàn)出的某種特征)。從科研上分又可分為細(xì)胞表型和動(dòng)物表型,有一點(diǎn)要知道疾病的表型不一定是特異性的,也具有通用性,這就像臨床上所說(shuō)的疾病的癥狀和體征有相似類似差不多。而且表型也分大小,表型中包括更小的表型。放心,大部分疾病都有大量的科研人員在研究,可以通過(guò)閱讀領(lǐng)域內(nèi)大牛的綜述來(lái)總結(jié),也可以查看相關(guān)基金的標(biāo)題(去國(guó)自然網(wǎng)站找),當(dāng)然還有一部分疾病的表型沒(méi)有被完全挖掘出來(lái),或者沒(méi)有人總結(jié)出來(lái)那就要自己去不斷的總結(jié)和發(fā)現(xiàn)了,不過(guò)先別急于發(fā)現(xiàn)和創(chuàng)新,先嘗嘗科研的滋味再去發(fā)現(xiàn)新的東西會(huì)讓你進(jìn)步的更快!

好了這里知道了疾病和表型,現(xiàn)在需要的就是你要自己去選擇,你想或者你導(dǎo)師想做疾病的某個(gè)或某幾個(gè)表型深入研究。為什么說(shuō)某個(gè)或某幾個(gè)呢??!注意,因?yàn)楸硇偷膽?yīng)用我們記住有三大特征:通用,嵌套和分裂。分別介紹通用顧名思義,就是這個(gè)表型在多個(gè)疾病的發(fā)展過(guò)程中都會(huì)出現(xiàn),比如腫瘤領(lǐng)域常常會(huì)和凋亡聯(lián)系起來(lái),那么凋亡就是多種癌癥的通用表型,你可以發(fā)現(xiàn)大部分腫瘤都是抑制凋亡的;嵌套也差不多,還是說(shuō)凋亡,隨著自噬獲得諾貝爾獎(jiǎng)后,多數(shù)學(xué)者都想在研究中添加一點(diǎn)這樣新的內(nèi)容,凋亡和自噬他們就存在著一定的因果關(guān)系,也就是存在者一定的嵌套,研究他們的文章數(shù)量不在少數(shù),除了因果嵌套還有平行嵌套,這里的研究通常是為了增加文章的工作量,在邏輯的深度上稍微淺顯一些;還有就是分裂,表型也可以分裂成幾個(gè)小的表型去研究,這塊我舉不出什么合適的例子,大家可以在閱讀中不斷的總結(jié)!

恒量3-模型

既然你都知道研究的疾病和表型了,那么就可以去尋找你這個(gè)疾病的表型大家(大牛們)都用什么模型去代替人類來(lái)研究它,這里的模型前面說(shuō)過(guò)它常常分為兩類:細(xì)胞表型和動(dòng)物表型,那么在實(shí)驗(yàn)的順序上周末決定呢?一般如果在醫(yī)院你可能在某個(gè)科室,而某個(gè)科室必定是研究某種或者某類的疾病,那么一般先做動(dòng)物,看看動(dòng)物表型有沒(méi)有變化來(lái)決定是否繼續(xù)研究。而如果你是一個(gè)“科學(xué)家”,他們可能更傾向于先做細(xì)胞表型,看看有沒(méi)有變化,或者有沒(méi)有想要的變化,有想要的你可以順著這個(gè)疾病繼續(xù)做下去,沒(méi)有你想要的或者發(fā)生了其他的變化你可以終止或者轉(zhuǎn)變研究方向,可以換一個(gè)疾病領(lǐng)域去搞搞!?。ú贿^(guò)這就比較曲折啦,不過(guò)卻不少發(fā)生,要看運(yùn)氣啦??????)關(guān)于模型資料的查詢,無(wú)疑是相信影響因子更高的article或者reviews,也可以去查查國(guó)自然,再不濟(jì)可以看看國(guó)內(nèi)碩博論文。一定要做好前期的工作,不然可能事倍功半,事倍功半,事倍功半,重要的事情說(shuō)三遍?。。?!

恒量4-方法

這里的方法就是實(shí)驗(yàn)的具體內(nèi)容了,別小看這部分,盡管市面上有很多成型的商品化試劑盒,也有流水線式的操作說(shuō)明,但是想要做出穩(wěn)定,可靠的數(shù)據(jù)也不是那么容易的。這要求你每一步都不能出錯(cuò),拿到的試驗(yàn)方案protocol確保是沒(méi)問(wèn)題,或經(jīng)過(guò)驗(yàn)證的。還有就是重復(fù)!重復(fù)!再重復(fù)!現(xiàn)在搞不好你造假了你機(jī)子都不知道造假了?。?!那如果因?yàn)檫@樣以后被舉報(bào)發(fā)現(xiàn)了你也太倒霉了?。?!

恒量5-標(biāo)志(物)

不管是研究什么疾病,表型,它都因該有一些特異性的東西,特異性也就是可以通過(guò)這幾個(gè)參數(shù)就能夠知道我研究的就是這個(gè)表型,這個(gè)疾?。。?!懂了嗎,這個(gè)需要自己去總結(jié),標(biāo)志物可以是核酸也可以是蛋白,更可以是一些特異性的實(shí)驗(yàn)或參數(shù)。


一篇文章你之所以看不懂,是因?yàn)槭紫日也坏轿恼滤饕磉_(dá)的中心思想,找不到文章中的關(guān)鍵點(diǎn),或者叫變量,另外還有就是理不清文章的基本邏輯!(剛開(kāi)始我覺(jué)得科研這么高大上的東西,邏輯上是不是一般人都不能理解的,如果這樣就錯(cuò)了,其實(shí)越高深的東西,在邏輯上越是簡(jiǎn)單,只是思維具有較高的深度,這也是可以通過(guò)鍛煉獲得的能力

這里給大家理一理常見(jiàn)三個(gè)變量:藥物、分子、通路

一篇文章中一般有且只有一個(gè)主變量,這樣才能講清楚文章的中心思想,其他的變量可以充當(dāng)為文章的因變量,在核酸和蛋白的維度上可以充當(dāng)為上游和下游的意思

藥物:不用說(shuō)也知道,這里包括已知的藥物和新藥

分子:這里比較多了,包括核酸(mRNA、MicRNA、LinRNA等等),蛋白(膜蛋白,胞漿蛋白和核蛋白)以其他的一些內(nèi)源性或外源性小分子

通路:通路這里要引用一句話,這個(gè)世界上本沒(méi)有通路,研究的人多了就有了通路,其實(shí)通路就是已知的一些分子,只不過(guò)科學(xué)家們已經(jīng)搞清楚了它們大概的上下游關(guān)系,誰(shuí)調(diào)控誰(shuí),誰(shuí)被誰(shuí)調(diào)控,連成復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò)圖或者是“連連看”就是我們今天所說(shuō)的通路,一般通路的研究很容易發(fā)現(xiàn),你看到一堆的western和PCR的圖很有很可能就是通路的研究!!

好了這里介紹一下如何增加文章的邏輯層次,如何能穩(wěn)定的增加文章的投稿檔次,這里需要變量和表型之間的搭配了;

通常有單變量、二元變量、三元變量、多元變量,一般研究大都在三元變量以下進(jìn)行研究,多了容易繞進(jìn)去,而且高分的文章一不一定就是一堆變量的堆疊,更體現(xiàn)的是新,和意義!

根據(jù)文章的深度一般而言,我們也能直觀的感受到,可以找?guī)灼恼略囋嚳?!一?分以下的文章通常不涉及到機(jī)制的研究,何為機(jī)制研究,就是涉及到通路,多表型的研究,過(guò)了3分大多會(huì)涉及到通路和多表型。

單變量:不用說(shuō),它就是文章的核心

二元變量:

藥物+通路

藥物+分子

分子+通路

分子+分子

(通路一般不做主變量)

三元變量

藥物+分子+通路

分子+分子+通路

分子+分子+分子

多元變量以上進(jìn)行類推,大多用不太到,記住變量再多只有一個(gè)主變量,其他的都是因變量,先學(xué)會(huì)上面的以后在復(fù)雜也不會(huì)害怕!

了解了變量之間的搭配,接下來(lái)就是變量和表型的搭配,其實(shí)表型的搭配前面提過(guò),一篇文章一邊不會(huì)只講一個(gè)表型,但是也不是沒(méi)有例外,講一個(gè)表型自然簡(jiǎn)單,直接在將變量進(jìn)行變換之后看一看表型涉及的實(shí)驗(yàn)指標(biāo)的變化就知道了,多變量這里涉及的就會(huì)深入一些,包括平行表型研究,就是改變變量看看多個(gè)表型的變化,理理思路成為一篇文章,還有一個(gè)就是表型的因果嵌套,這會(huì)更復(fù)雜一些,就是上一個(gè)表型和下一個(gè)表型有關(guān)系,這種關(guān)系要在實(shí)驗(yàn)中體現(xiàn)出來(lái),就要涉及到回復(fù)實(shí)驗(yàn),也就是人們常說(shuō)的rescue實(shí)驗(yàn),一般會(huì)抑制一個(gè)表型看另外一個(gè)表型變化。以后咱們?cè)倬唧w說(shuō)rescue實(shí)驗(yàn)

這里可能講的不是很清楚,但也算是自己的一些感悟,這里給一張圖,大家慢慢領(lǐng)悟




單變量和表型嵌套


三元變量

最后聲明此套理論并非來(lái)自本人,均出自解螺旋的課程,寫這些也是為了鞏固學(xué)習(xí),加深理解。接下來(lái)會(huì)給大家不斷的撰寫心得和大家一起交流學(xué)習(xí)!

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