研究生如何運(yùn)用SEER數(shù)據(jù)庫如何快速發(fā)SCI

目前在國(guó)內(nèi)醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,包括各大三甲醫(yī)院、科研機(jī)構(gòu)和院校,SCI論文的發(fā)表正在逐漸成為一個(gè)硬性的要求。

首先是醫(yī)院臨床醫(yī)師職稱的晉升,文章是最重要的評(píng)價(jià)體系,畢竟一直處于住院醫(yī)或主治的狀態(tài)確實(shí)不好受,臨床工作和夜班的雙重壓力加持對(duì)于大家身心健康是個(gè)巨大的影響因素。對(duì)于臨床一線工作者來說,時(shí)間是最大的成本。


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而對(duì)于還在醫(yī)學(xué)院校讀研和讀博的同學(xué),能否順利發(fā)表sci首先是直接關(guān)乎到我們能否畢業(yè),這個(gè)其實(shí)也是我們醫(yī)學(xué)生最為焦慮甚至導(dǎo)致失眠的事情,尤其是后面有導(dǎo)師和師兄師姐瘋狂的push你的時(shí)候,這個(gè)是我們醫(yī)學(xué)生焦慮的根源。

而對(duì)于升學(xué),985,211的醫(yī)學(xué)院校碩博面試的時(shí)候?qū)熆赡芊浅?粗厥欠裼蠸CI論文的發(fā)表,尤其是對(duì)于現(xiàn)在正在推行的博士申請(qǐng)考核制來說。

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我本人研究生畢業(yè)已經(jīng)2年,在讀期間以第一作者發(fā)表sci 2篇,共同第一作者發(fā)表sci 3篇,現(xiàn)階段為醫(yī)學(xué)科研技術(shù)交流的自由職業(yè)者。總結(jié)一下我們可能發(fā)文的途徑和現(xiàn)狀:

  1. META:剛?cè)雽W(xué)??赡苡袔熃銕熜滞扑]你發(fā)meta文章,因?yàn)樵诖蠖鄶?shù)醫(yī)學(xué)生眼中meta文章很耗費(fèi)。但是這個(gè)地方大家要注意難的不是分析方法(什么森林圖的繪制,統(tǒng)計(jì)軟件R或stata的使用,這些不是難點(diǎn)),而是選題很難,因?yàn)榉治龇椒ǘ际枪潭ǖ?,但你想到的很多選題都已經(jīng)被發(fā)表過。況且很多醫(yī)學(xué)院校不認(rèn)可meta文章來作文畢業(yè)文章。
  2. 基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn):對(duì)于臨床醫(yī)師和臨床型研究生幾乎不可能有時(shí)間去實(shí)驗(yàn)學(xué)習(xí)做實(shí)驗(yàn),這個(gè)工作是一個(gè)非?!案巍钡墓ぷ?,會(huì)耗費(fèi)巨大的時(shí)間和精力,而且不一定能做出結(jié)果,所有這個(gè)對(duì)于非專業(yè)科研的我是極力不推薦的
  3. 生物信息學(xué):這個(gè)要分倆種情況,一是課題組有自己的經(jīng)費(fèi)去做測(cè)序并得到自己的測(cè)序數(shù)據(jù),這一類生信文章還可以結(jié)合公共數(shù)據(jù)庫和部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn),這一類文章比較好發(fā)表。二是純公共數(shù)據(jù)庫生信文章,現(xiàn)在的情況確實(shí)也可以發(fā)表,但是大家要明白就是這個(gè)是投稿的門檻越來越高,簡(jiǎn)單的來說就是很難投,中稿的是少數(shù)人,因?yàn)槟壳吧虐l(fā)文的趨勢(shì)是生信分析結(jié)合基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)。
  4. 臨床文章:這個(gè)才是醫(yī)生和醫(yī)學(xué)生真正能夠拿到數(shù)據(jù)源并且進(jìn)行快速撰寫的一類。一般臨床數(shù)據(jù)源分倆種:一是你所在科室的數(shù)據(jù),自己搜集,可能0.5-1H一例樣本,主要是搜集速度較慢,二是公共數(shù)庫:SEER,MIMIC。MIMIC是重癥醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù),且注冊(cè)相比SEER麻煩的不止一星半點(diǎn),而且最反人類的就是居然要用SQL進(jìn)行數(shù)據(jù)查詢,也就是說讓醫(yī)學(xué)研究者用數(shù)據(jù)庫編程語言去搜索數(shù)據(jù)庫。而SEER是唯一最全最友好的回顧性研究臨床腫瘤和死亡率統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)庫,且數(shù)據(jù)源可以快速獲取。結(jié)合自己的數(shù)據(jù)和SEER數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)進(jìn)行選題、分析,這個(gè)也是我目前最為推薦也是最為靠譜的快速發(fā)表SCI方式,對(duì)于節(jié)約我們的時(shí)間成本是最為有效的途徑。大家看到的有些同學(xué)一年發(fā)2-3篇,很多就是臨床文章花式變化選題之后進(jìn)行的論文發(fā)表。
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但是對(duì)于初學(xué)者,使用SEER數(shù)據(jù)庫進(jìn)行臨床模型文章發(fā)表SCI下面幾個(gè)最大的難題:

  1. SEER數(shù)據(jù)庫賬號(hào)注冊(cè)及數(shù)據(jù)下載、數(shù)據(jù)篩選和字段編碼注釋:**SEER數(shù)據(jù)庫在數(shù)據(jù)下載及編碼注釋上的查詢流程寫的非常模糊,初學(xué)者很多時(shí)候是完全懵的。
  2. 臨床數(shù)據(jù)分析和臨床模型建立的方法學(xué)探索困難:如COX回歸的亞組分析森林圖、GIVITI曲線、決策分析曲線,PSM,競(jìng)爭(zhēng)風(fēng)險(xiǎn)模型以及機(jī)器學(xué)習(xí)等代碼和實(shí)戰(zhàn)流程的資料很少。在方法學(xué)的學(xué)習(xí),我們提倡就是完整性,以及發(fā)表臨床數(shù)據(jù)分析論文的方法學(xué)你盡量都要掌握
  3. 統(tǒng)計(jì)分析工具的學(xué)習(xí):這里如果是剛開始做科研的的同學(xué),我強(qiáng)烈建議你直接從R起步,跳過SPSS,STAT等統(tǒng)計(jì)軟件,R是未來數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)的趨勢(shì),可以替代SPSS和STAT的任何分析和功能
  4. 論文投稿決策:大家很多人可能還未意識(shí)到,論文的發(fā)表是一個(gè)系統(tǒng)性的工程。而我們很多人只過分關(guān)注于學(xué)習(xí)臨床數(shù)據(jù)分析的方法學(xué),而忽略了這至關(guān)重要的一步。很多時(shí)候我們發(fā)現(xiàn)論文寫完時(shí)候卻投不出去,屢次拒稿,浪費(fèi)了大量的時(shí)間和精力,最后導(dǎo)致導(dǎo)師對(duì)我們的研究失去信心或者耐心,這個(gè)其實(shí)也是很多碩士和博士所最為困擾的一點(diǎn),也是碩博研究生焦慮的根源。然而為什么會(huì)被聯(lián)系拒稿?這個(gè)地方大家要意識(shí)到一個(gè)問題就是論文的評(píng)定是編輯和審稿人決策,既然是人的行為,那就必然有偏好,如果我們?cè)谶x擇雜志時(shí)不去考慮這個(gè)潛在的偏好因素,我們做的一切工作都只能變成我們的自嗨。所以當(dāng)我們屢次被拒稿的時(shí)候我們必須冷靜下來去分析不同的雜志,去搜集信息去決策,去分析雜志編輯接收論文的偏好,但是怎么去做,這個(gè)非常關(guān)鍵。**同樣在同期眾多1000~2000的稿件中,如何去獲得雜志編輯的關(guān)注,這個(gè)也是大家必須要思考的問題。
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在這里我以個(gè)人經(jīng)驗(yàn)說幾點(diǎn):

  1. 任何數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)下載及轉(zhuǎn)換都需要探索,對(duì)于SEER數(shù)據(jù)庫來說,要尤其在官網(wǎng)頁面的SEERdata頁面進(jìn)行仔細(xì)查找和搜索
  2. 臨床數(shù)據(jù)分析方法大家要學(xué)習(xí)一些更新的臨床數(shù)據(jù)模型和方法,nomogram這個(gè)雖然目前還能發(fā)文,但創(chuàng)新性已大打折扣
  3. R語言學(xué)習(xí),大家要先學(xué)習(xí)R語言最核心的內(nèi)容,就是數(shù)據(jù)類型和數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu),包括python,golang也是如此。對(duì)于R的學(xué)習(xí)來說,我個(gè)人認(rèn)為數(shù)據(jù)類型和數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)占R學(xué)習(xí)70%,剩下30%就是照搬代碼。
  4. 文章寫完投哪個(gè)雜志,這里我建議大家要對(duì)臨床數(shù)據(jù)論文和雜志做系統(tǒng)性的信息分享,找出近倆年SEER相關(guān)文章的投稿趨勢(shì),對(duì)雜志進(jìn)行層級(jí)的歸類。

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