每日paper - 20220523 - 佛羅里達(dá)美洲獅的遺傳救助

Genetic restoration of the Florida panther

2010 年由美國國家癌癥研究所基因組多樣性實(shí)驗(yàn)室的 Stephen J. O'Brien 團(tuán)隊(duì)發(fā)表在 Science 上。第一作者為 Warren E. Johnson、David P. Onorato、Melody E. Roelke 和 E. Darrell Land。

佛羅里達(dá)美洲獅(Florida panther, Puma concolor coryi)是一個(gè)瀕危的支系,也是北美洲東部最后的美洲獅亞種。1995 年,保護(hù)工作者從德克薩斯州引入了八頭雌性美洲獅(Puma concolor stanleyana),以期提高佛羅里達(dá)美洲獅群體的遺傳多態(tài)性、擴(kuò)大種群、扭轉(zhuǎn)近交衰退。研究者們發(fā)現(xiàn),項(xiàng)目實(shí)施以來,群體大小翻了三倍,遺傳多樣性提高了一倍,存活率和適合度也提高了,近交系數(shù)也顯著降低。

研究者們比較了從 1978 到 2009 年的 591 只個(gè)體的 23 個(gè)短串聯(lián)重復(fù)序列(STR)。根據(jù) STR,這些美洲獅可以聚為九個(gè)類群,雜交后代能夠很好地被區(qū)分出來。

Fig. 2?Neighbor-joining tree of composite STR genotypes portraying genetic relationships among pre-1995 founding CFPs, introduced TX females, EVG and F1?admixed Florida panthers (CFPxTX-F1?and EVGxTX-F1).?

研究者們以此為基礎(chǔ),重建了引入德克薩斯美洲獅前后的群體動(dòng)態(tài)、雜交和回交的情況。對不同時(shí)期的樣本,計(jì)算雜合度等。1996 到 2003 年間,個(gè)體數(shù)目以每年增長 14% 的速度增長至至少 95 只成年個(gè)體。與此同時(shí),有效種群大小和雜合度都在提高。在 2004 年之后,種群增長速度放緩。

Fig. 3?(A) Minimum annual subadult and adult panther population size and inferred genetic heritage from 1986 to 2007. CFPs are yellow, EVGs pink, TXs red, CFPxTX-F1s and EVGxTX-F1s orange, TX-BCs and other AdmFPs shades of orange, and genetically uncharacterized individuals (Unk) gray (13). The black line is an independent minimum-count estimate from surveys of tracks, spoor, and other field evidence (2). (B) Mean yearly adult multilocus heterozygosity. (C) Yearly mean age of adults. (D) Projected survivorship (probability of surviving to an age) curves for female Florida panthers of different genetic heritages with standard error bars (13). Male trends are similar (table S4).

將遺傳數(shù)據(jù)與適合度數(shù)據(jù)(通過表型、life history 等反映)結(jié)合,發(fā)現(xiàn)混合祖先成分與子一代高存活率有關(guān)(這里對存活率進(jìn)行了很多細(xì)分,對不同類群不同年齡段都有區(qū)分,還有免疫能力等等,這里不詳述)。

雖然這些結(jié)果令人鼓舞,但是佛羅里達(dá)美洲獅的保護(hù)情況仍然不容樂觀,棲息地喪失、長期存在的近交、病原體感染、以及可能存在的棲息地飽和仍然是保護(hù)道路上的巨大障礙。保護(hù)大型捕食者的工作是艱巨的。

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