前言
我還未想到這個(gè)專題叫什么......
暫定“XXX就那樣”?
我們先來個(gè)斗雞眼,看著一下中間的QT。
1.什么是數(shù)量性狀?(quantitative trait,QT)
? ? ? 我覺得,在理解數(shù)量性狀之前,首先需要理解它的“對家”(正如要讀懂女人的話,是要反著聽一樣)——質(zhì)量性狀(discrete characters)。
? ? ?“質(zhì)量”,我覺得翻譯得不好,別人明明就是discrete (adj. 離散的,不連續(xù)的),怎么嘛,叫個(gè)離散性狀也好理解一點(diǎn)。
? ? ? 根據(jù)百度百科,生物界的一類性狀如紅與白、有與無等稱質(zhì)量性狀。那么就是說,你女朋友愛你或不愛你,to be or not to be,就是一個(gè)質(zhì)量性狀。
? ? ? 但是,有一些“愛”,往往不是全或無的關(guān)系,是帶有一定的“漸變過程”,如結(jié)婚后,你老婆說“你越來越不愛我了”!
? ? ? 好了,感覺我們可以開始了解,什么是數(shù)量性狀了。
? ? ? 其實(shí),自然界中有很多這些“性狀”, 如牛的奶分泌得多不多,你后院種的橘子今年果實(shí)多不多,養(yǎng)的羊毛長不長,你親戚朋友的高血壓、糖尿病嚴(yán)不嚴(yán)重、基因表達(dá)的高低等,當(dāng)然你也可以關(guān)注家里的貓拉的屎多不多(鏟屎官們懂的)。
? ? ? ?因此,所有能夠度量的性狀都可以成為數(shù)量性狀(quantitative character或quantitative traits,QT),包括“你~問~我愛你~有多深?”
2.什么是數(shù)量性狀位點(diǎn)??(quantitative trait locus,QTL)
? ? ? ?多了一個(gè)L!
? ? ? ?數(shù)量性狀位點(diǎn)(Quantitative trait locus, QTL)就是一個(gè)性狀由多個(gè)基因決定,每個(gè)基因?qū)Υ诵誀疃际俏⑿У摹?/p>
? ? ? ?簡單來說,你另一半變心了(性狀),是有多個(gè)原因確定的,對你失望了(基因A),有強(qiáng)大的的第三者(基因B),下雨天(基因C,不要問我為什么“分手總要在雨天”,問張學(xué)友~)
? ? ? ?好了,問題來了! 人嘛,是一種犯賤的動(dòng)物,分手了(某一個(gè)數(shù)量性狀),總是想知道原因的(哪些基因?qū)е铝朔质郑?/b>
? ? ? ?現(xiàn)實(shí)中,你可以請私家偵探,問周邊的人等這些手段,查個(gè)究竟。那么在基因研究中,有哪些手段(分析技術(shù)),查到數(shù)量性狀基因座(各種分手原因)呢?
? ? ? ?常見的數(shù)量性狀基因座(QTL)分析技術(shù)有(私家偵探社都有好幾家啦,名偵探柯南,金田一等):擴(kuò)增片段長度多態(tài)性(AFLP)或更常見的SNP等分子標(biāo)簽技術(shù),來對實(shí)際造成性狀變異的基因進(jìn)行鑒定與測序。
3.什么是表達(dá)數(shù)量性狀基因座分析(Expression quantitative trait loci ,eQTL)
? ? ? ?好了,這里又多了一個(gè)e!
? ? ? ?e=expression(基因表達(dá)),就是一個(gè)關(guān)心遺傳變異(QTL)如何導(dǎo)致基因表達(dá)差異。
? ? ? ?簡單來說,就是,變心(遺傳變異)后,所造成分手的差異(有的哭(表達(dá)出來,expreesion),有的分開各自各生活了(splicing),有的狂吃(protein),有的變基佬了(甲基化,methylation),有些核染色質(zhì)(chromatin)、組蛋白(histone)都變了?。?/p>

? ? ? ?所以,你分手后喜歡養(yǎng)貓,那就是CatQTL,喜歡養(yǎng)狗就是DogQTL,喜歡到山上去優(yōu)雅了,那就是山上優(yōu)雅QTL。Whatever~
? ? ? ?總之,eQTL只是眾多QTL研究中的一種,但是,夠你學(xué)的了~任何東西都是細(xì)思恐極的!~
4.進(jìn)一步了解eQTL
? ? ? 好,我們進(jìn)一步深入了解一下山上優(yōu)雅QTL,噢不,是eQTL。
? ? ? 本質(zhì)上,eQTL就是研究基因上某一個(gè)位置的變化(堿基改變,如原本是A的變成了G)后,是如何改變了基因表達(dá),如下圖:

? ? ? ? ?好了,為什么要研究遺傳突變與基因表達(dá)的相關(guān)性?
? ? ? ? ?很簡單,就是某一個(gè)基因上某一個(gè)位置的變化并不一定會(huì)影響mRNA的產(chǎn)生或者蛋白的改變,也就有可能不會(huì)影響到疾病或其他生物學(xué)過程。(換句話說,就是遺傳學(xué)的單核苷酸多態(tài)性,人都是多狀態(tài)的,但不一定是變態(tài)的(致?。?。
? ? ? ? ?所以,聰明的科學(xué)家就想,既然“I have a 遺傳突變數(shù)據(jù)(如GWAS)“,”I have a 基因表達(dá)數(shù)據(jù)(如轉(zhuǎn)錄組測序)”,如何”UH~~~“在一起研究疾病?

5.最終,實(shí)現(xiàn)“人類GWAS-轉(zhuǎn)錄組-疾病表型補(bǔ)完計(jì)劃”!

つづく
參考文獻(xiàn):
1.Brandt, Margot, and Tuuli Lappalainen. "SnapShot: discovering genetic regulatory variants by QTL analysis."?Cell171, no. 4 (2017): 980-980.
2.簡書:http://www.itdecent.cn/p/2e1e9d3ccd63
3.https://www.cnblogs.com/leezx/p/10795353.html