使用conda安裝

bash Miniconda2-.......sh

同意conda添加到.bashrc后就可以直接在環(huán)境中使用conda命令了
$ source ~/.bashrc
$ conda

進入到rnaseq環(huán)境
$ conda activate rnaseq

$ conda install -c bioconda trimmomatic

不想顯示提醒：conda install trimmomatic -y 

查看環(huán)境內(nèi)安裝軟件

(rnaseq) root 17:34:53 ~/miniconda3/envs/rnaseq/bin
$ ls

已安裝的軟件：

trimmomatic、cutadapt、trim_galore

star、hisat2、bowtie2、bwa、subread

htseq、bedtools、deeptools

下一篇我們將進入處理流程。

我們下一篇再見！