單細胞轉錄組及空間轉錄組學習資源

(1). 單細胞上游軟件cellranger：單細胞上游軟件cellranger從頭說

(2). singleR操作說明：singleR

(3). seurat操作說明：seurat官網(wǎng)；seurat官方教程：seurat教程

(4). 多組學單細胞教程：OSCA

(5).單細胞課程：
scrnaseq-course
SingleCellWorkshop2020
NBIS-2021
youtube-videos
哈佛大學單細胞課程

(6).10x公司的案例video：video；案例

(7). 單細胞去除批次效應的軟件合集文章：
A benchmark of batch-effect correction methods for single-cell RNA sequencing data，可白嫖GitHub上的操作：Github入口，上面有各類軟件的測試數(shù)據(jù)和使用代碼

(8).分析類流程：Current best practices in single‐cell RNA‐seq analysis: a tutorial

(9).單細胞細胞注釋方法類文章：Tutorial: guidelines for annotating single-cell transcriptomic maps using automated and manual methods

(10). 單細胞軌跡推斷個人比較推薦使用dyno，因為該軟件集合了很多種逆時間分析的算法，并且做成了shiny，網(wǎng)址：https://github.com/dynverse/dyno

(11). 附加一個空間轉錄組的教程：空間轉錄組教程

轉載來自 作者：小潤澤 鏈接：http://www.itdecent.cn/p/b7363e6df316

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