畢達(dá)哥拉斯派的觀點(diǎn)與伊奧尼亞派正好相反，后者認(rèn)為本原是單一和可變的，而畢達(dá)哥拉斯派則認(rèn)為數(shù)是世界的本原，而數(shù)是眾多和不變的，理由有二。
首先，他認(rèn)為，一切事物的性質(zhì)都可以被歸結(jié)為數(shù)的規(guī)定性。因?yàn)楸绕鹚?，火和氣這些質(zhì)料性本原而言，數(shù)與存在物之間具有更多的相似性，即數(shù)的規(guī)定性比物理屬性更加普遍。因此，數(shù)構(gòu)成了宇宙模型，世界的現(xiàn)象遵循著數(shù)學(xué)規(guī)律。數(shù)學(xué)的規(guī)定性包括三類：一是數(shù)學(xué)的比例關(guān)系，它決定了事物構(gòu)造及事物之間的和諧性；一是數(shù)學(xué)的對(duì)立關(guān)系，如奇數(shù)與偶數(shù)；一是數(shù)字代表自然和社會(huì)屬性的類比關(guān)系，如10代表完滿。其次，數(shù)先于事物而存在，人需要通過(guò)數(shù)才能認(rèn)識(shí)事物。數(shù)是構(gòu)成事物的基本單元，幾何結(jié)構(gòu)與數(shù)字相對(duì)應(yīng)：1是點(diǎn)，2是線，3是面，4是體。世界生成的過(guò)程：點(diǎn)產(chǎn)生線，線產(chǎn)生面，面產(chǎn)生體，體產(chǎn)生水，火，土，氣四種元素，四元素構(gòu)成可感事物。
比起質(zhì)料性本原說(shuō)，數(shù)本原說(shuō)帶來(lái)了“形式”的概念，將人引入思辨的層面，關(guān)注非感性的對(duì)象。畢達(dá)哥拉斯對(duì)靈魂的三重區(qū)分，以及對(duì)數(shù)學(xué)的重視，對(duì)柏拉圖的理念論和靈魂學(xué)說(shuō)產(chǎn)生重大的影響。但亞里士多德批評(píng)他混淆了抽象的數(shù)字單元和有體積的物理質(zhì)點(diǎn)，從而提出數(shù)字構(gòu)成可感事物的荒謬結(jié)論。
