繼續(xù)Linux入門(mén)??
1. conda/ miniconda
快速體驗(yàn)安裝-配置-使用說(shuō)實(shí)話沒(méi)有體會(huì)到??
wget +粘貼（鼠標(biāo)右鍵） #下載miniconda
cp /home/doudou/biosoft/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh ~/biosoft #直接把其他文件夾里面的拷貝過(guò)來(lái)
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh #安裝它！??
#可以類推其他軟件安裝#
source ~/.bashrc #還要激活它
conda #再召喚一下 看看成功了沒(méi)?
conda list #查看當(dāng)前所有軟件
conda search XXXXX #搜索軟件
conda search fastqc # 舉個(gè)栗子
conda install fastqc -y #- 安裝軟件/此下還是舉fastqc， -y和不-y的區(qū)別？我沒(méi)試，可能后面會(huì)問(wèn)yes /no？
conda remove fastqc -y #卸載XXXX軟件 小小好奇這個(gè)-y和不-y的區(qū)別？
2. 使用鏡像
清華鏡像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
摘自：生信星球
3. 補(bǔ)充些
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conda
Conda是一個(gè)開(kāi)源跨平臺(tái)語(yǔ)言無(wú)關(guān)的包管理與環(huán)境管理系統(tǒng)。其允許用戶方便地安裝不同版本的二進(jìn)制軟件包與該計(jì)算平臺(tái)需要的所有庫(kù)。還允許用戶在不同版本的包之間切換、從一個(gè)軟件倉(cāng)庫(kù)下載包并安裝。
Conda是用Python語(yǔ)言開(kāi)發(fā)，但能管理其他編程語(yǔ)言的項(xiàng)目（如R語(yǔ)言），包括多語(yǔ)言項(xiàng)目。Conda可安裝Python語(yǔ)言的包，類似于其他基于Python的跨平臺(tái)包管理器（如wheel或pip）。
一些基于Conda的工具軟件：
Bioconda，用于計(jì)算生物學(xué)。
Anaconda
Miniconda
Anaconda Repository.
來(lái)源：維基百科
放梯子備用Conda-github
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fastQC
クオリティチェックの代表的なプログラムとして FastQC がある。FastQC は Java で書(shū)かれているため、OS を問(wèn)わずにダウンロードすればすぐに利用できる。Linux 上では GUI 畫(huà)面が利用できるに加え、コマンドラインからも利用でき、非常に便利なプログラムである。|
RNA測(cè)序-質(zhì)量控制-快速質(zhì)量控制
?? 梯子們 太多了要看呀
官網(wǎng)
霓虹版
知乎版
再補(bǔ)一下看fastQC報(bào)告
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End
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