GO富集分析原理簡介和DAVID的GO富集分析方法操作演示
????尋找差異表達的基因并挖掘它們可能的功能,是我們進行RNA測序的最主要目的。很明顯,這些差異的基因必然與功能改變密切相關,例如,比較患病個體與正常個體的組織表達譜,不難想到這些表達顯著改變的基因參與了疾病或免疫相關的生物學過程、信號通路等,基因表達水平的失調(diào)與疾病肯定密不可分。
????我們平時看RNA-seq相關的文獻時,文章中在鑒定了差異表達的基因后,大都會在隨后承接幾句關于這些失調(diào)基因所涉及通路的描述。例如,討論這些差異基因主要映射到哪些GO或KEGG分類條目中,以說明基因表達的改變會導致哪些調(diào)控途徑原有功能失調(diào),進而與表型聯(lián)系起來。通常稱這種分析為GO、KEGG富集分析。
????本節(jié)視頻教程,就讓我們帶大家學習什么是GO、KEGG富集分析,它們的主要原理是什么,并簡單展示使用DAVID進行差異表達基因GO富集分析的操作過程。
視頻教程:
紀偉講測序-GO基因功能富集分析教程
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