R包

安裝加載R包

• file.edit('~/.Rprofile')#編輯配置文件
  將這兩個(gè)代碼輸入編輯文件，以后打開(kāi)Rstudio自動(dòng)運(yùn)行

options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) #對(duì)應(yīng)清華源
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") #對(duì)應(yīng)中科大源

options()$repos
options()$BioC_mirror

檢查是否成功

• 安裝dplyr

install.packages("dplyr")
library(dplyr)

dplyr五個(gè)基礎(chǔ)函數(shù)

1. mutate()#新增列
   
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2. select()#按列篩選
   
   image.png
   
   3.filter()#篩選行
   
   image.png
3. arrange()#按某1列或某幾列對(duì)整個(gè)表格進(jìn)行排序
   
   image.png
4. summarise()#匯總
   
   image.png

dplyr兩個(gè)實(shí)用技能

1. %>% (cmd/ctr + shift + M)管道操作
   
   image.png
2. count#統(tǒng)計(jì)某列的unique值
   
   image.png

dplyr處理關(guān)系數(shù)據(jù)

1. 連接兩個(gè)表

   
   
   image.png
2. inner_join#內(nèi)連取交集
   
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3. left_join#左連
   
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4. full_join#全連
   
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5. semi_join#半連接：返回能夠與y表匹配的x表所有記錄
   
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6. anti_join#反連接：返回?zé)o法與y表匹配的x表的所記錄
   
   image.png

7. 簡(jiǎn)單合并

   
   
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