利用tbtools批量計(jì)算KaKs值


如上圖需要準(zhǔn)備三個(gè)文件。

1.一個(gè)###必須的###基因?qū)π畔⑽募?,大體格式如下(tab分割):

2. 一個(gè)##必須的##cds序列文件(其中必須包括要用到的基因?qū)?duì)應(yīng)的CDS序列),如下:

3.一個(gè)###可選的###蛋白序列文件(fasta格式),如果沒有這個(gè)文件,那么TBtools會(huì)使用標(biāo)準(zhǔn)密碼子表,將CDS序列全部翻譯為蛋白序列,作為分析使用,如下:

4.輸出結(jié)果

?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請(qǐng)聯(lián)系作者
【社區(qū)內(nèi)容提示】社區(qū)部分內(nèi)容疑似由AI輔助生成,瀏覽時(shí)請(qǐng)結(jié)合常識(shí)與多方信息審慎甄別。
平臺(tái)聲明:文章內(nèi)容(如有圖片或視頻亦包括在內(nèi))由作者上傳并發(fā)布,文章內(nèi)容僅代表作者本人觀點(diǎn),簡(jiǎn)書系信息發(fā)布平臺(tái),僅提供信息存儲(chǔ)服務(wù)。

友情鏈接更多精彩內(nèi)容