The Landscape of Circular RNA in Cancer

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1.外顯子捕獲技術(shù)RNA-seq技術(shù)優(yōu)于Ribo-Zero
2.PRAD和BRCA受激素調(diào)節(jié)影響 與轉(zhuǎn)錄因子有極大相關(guān)性
3.R shiny 可以開發(fā)網(wǎng)站
4.我們可以下載數(shù)據(jù)對區(qū)域做注釋
5.宿主基因的表達(dá)和circRNA的表達(dá)沒有直接關(guān)系,但兩者差異趨勢一樣
6.借鑒以下圖做表達(dá)散點(diǎn)圖 橫縱坐標(biāo)卡閾值 取大于90%樣本

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7.circRNA側(cè)翼內(nèi)含子長度越長,表達(dá)越高
8.基因融合circRNA
(1)f-circRNA:跨染色體融合
(2)RT-circRNA:同一染色體相鄰基因融合
9.在UCSC上下載重復(fù)原件 ----形成circRNA的必要條件
10.circRNA半衰期長 可以作為臨床Biomarker
11.外泌體
1983年,外泌體首次于綿羊網(wǎng)織紅細(xì)胞中被發(fā)現(xiàn),1987年Johnstone將其命名為“exosome”,即外泌體。人體幾乎所有類型的細(xì)胞都能分泌外泌體,外泌體廣泛存在并分布于各種體液中,攜帶多種蛋白質(zhì)、mRNA、miRNA和脂質(zhì)類物質(zhì)等,作為重要的傳遞信號分子,形成了一種全新的細(xì)胞-細(xì)胞間信息傳遞系統(tǒng),可參與細(xì)胞通訊、細(xì)胞遷移、血管新生和腫瘤細(xì)胞生長等過程。
作者:南博屹生物醫(yī)學(xué)
鏈接:http://www.itdecent.cn/p/f54f058bde4e
來源:簡書
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12.一些好看的圖

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