三十六策 第 4 策 分子點(diǎn)睛

三十六策 第 4 策 分子點(diǎn)睛

第 4 策 分子點(diǎn)睛

疾、型、模、法、標(biāo)五恒量是一個(gè)研究方向的通用體系、常規(guī)套路。

分子這里主要是指 DNA,RNA,蛋白這些生物大分子。

第一個(gè)問(wèn)題,怎么來(lái)證明一個(gè)分子有某個(gè)方面的功能表型?

變量代入恒量,最基本的科學(xué)假設(shè),就是在什么疾病中分子能夠介導(dǎo)某種表型。證明一個(gè)分子有某個(gè)方面的功能表型的方法,就是操作分子,人為的改變這個(gè)分子的表達(dá),讓這個(gè)分子表達(dá)上升,觀察到表型, 然后再把這個(gè)分子表達(dá)降低,觀察到表型消失了,這就證明了表型的存在分子的上下表達(dá)有明顯的相關(guān)性,由此你可以下結(jié)論。

驗(yàn)證分子和表型的關(guān)系,需要通過(guò)操縱分子觀察表型來(lái)建立因果關(guān)系。

過(guò)表達(dá):在一個(gè)細(xì)胞模型中過(guò)表達(dá)一個(gè)分子的手段一共有兩類,一是質(zhì)粒,二是病毒。

  • 質(zhì)粒:是一種環(huán)狀的 DNA 分子,能夠把一段特定序列編碼 DNA 轉(zhuǎn)錄出 RNA 來(lái),接著 RNA 再翻譯成蛋白。把質(zhì)粒導(dǎo)入細(xì)胞→轉(zhuǎn)染:脂質(zhì)體、電穿孔、鈣轉(zhuǎn)。轉(zhuǎn)染 Transfection,轉(zhuǎn)導(dǎo) Transduction, 轉(zhuǎn)化 Transformation(質(zhì)粒在大腸桿菌里做轉(zhuǎn)化)。

  • 病毒:為了對(duì)付一些難以轉(zhuǎn)染的細(xì)胞。目的都是為了運(yùn)輸 基因到細(xì)胞里,實(shí)現(xiàn)基因的過(guò)表達(dá)。

正反雙向研究:圍繞一個(gè)分子找到相對(duì)高表達(dá)的和相對(duì)低表達(dá)的細(xì)胞,在高表達(dá)的里面抑制分子,在低表達(dá)的里面過(guò)表達(dá)分子就能實(shí)現(xiàn)正反雙向研究。

RNAi :合成一段 21 個(gè)堿基的 siRNA,轉(zhuǎn)染到細(xì)胞里就能對(duì)目標(biāo)基因?qū)崿F(xiàn) 70%以上的表達(dá)沉默。

第二個(gè)問(wèn)題,分子有很多具體類型

  • DNA:

    • 腫瘤中 DNA 的突變,缺失,重排已經(jīng)被證明是一大驅(qū)動(dòng)因素。

    • 表觀遺傳學(xué)是指基因序列不變情況下,基因表達(dá)水平的改變:DNA 甲基化,RNA 編輯,蛋白修飾

  • RNA

    • 編碼基因的 mRNA

    • 非編碼 RNA:miRNA、lncRNA、circRNA

總結(jié)

證明分子與表型之間關(guān)系的 Gain of function 和 Loss of function 一正一反兩種方法

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