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這里記錄下安裝alamode的過程，以便以后的繼續(xù)使用(只敘述我安裝的過程)，用的是ubuntu

1.依賴安裝(編譯器等)

1. Intel編譯器集群并行版本安裝
   包含了所需的C++ compiler，LAPACK library,MPI library (OpenMPI, MPICH2, IntelMPI, etc.),FFTW library庫
   

   image.png
   
   這里按著提示安裝，安裝完之后寫一下環(huán)境變量就行,環(huán)境變量如下(我這里裝在了/home/zhangsan/intel1目錄下)：

   # intel2020 
   source /home/zhangsan/intel1/compilers_and_libraries_2020.4.304/linux/bin/compilervars.sh intel64
   source /home/zhangsan/intel1/compilers_and_libraries_2020.4.304/linux/bin/ifortvars.sh intel64
   source /home/zhangsan/intel1/compilers_and_libraries_2020.4.304/linux/bin/iccvars.sh intel64
   export LD_LIBRARY_PATH=/home/zhangsan/intel1/compilers_and_libraries_2020.4.304/linux/mkl/lib/intel64_lin:$LD_LIBRARY_PATH
   export LD_LIBRARY_PATH=/home/zhangsan/intel1/lib/intel64_lin:$LD_LIBRARY_PATH
   

   記得

   source .bashrc
   

2. Boost C++ library和 Eigen3 library
   這連個(gè)安裝相同放在了一起

   • 比如你的用戶家目錄叫zhangsan，你的home目錄等同于$(home) == /home/zhangsan
   • 那么新建/home/zhangsan/ect的目錄把解壓完的兩個(gè)包放進(jìn)去,
   • 然后再創(chuàng)建一個(gè)/home/zhangsan/include目錄
   • 最后做個(gè)軟鏈接

     $ ln -s /home/zhangsan/etc/boost_1_75_0/boost /home/zhangsan/include/boost
     $ ln -s /home/zhangsan/etc/eigen-3.3.9/Eigen /home/zhangsan/include/Eigen
     

3. spglib安裝

   • 解壓完后也放到/home/zhangsan/ect
   • 然后安裝到/home/zhangsan/include/spblib目錄下，命令如下：

     $ cd /home/zhangsan/etc/spglib
     $ mkdir build && cd build
     $ cmake -DCMAKE_INSTALL_PREFIX="" ..
     $ make
     $ make DESTDIR=/home/zhangsan/include/spglib install
     

   • 添加進(jìn)環(huán)境變量

     # spglib
     export LD_LIBRARY_PATH=/home/one/include/spglib/lib:$LD_LIBRARY_PATH
     

2.編譯alamode

1. 先這個(gè)軟件下下來，用git比較方便

   git clone https://github.com/ttadano/alamode.git
   

   然后解壓后依舊放到/home/zhangsan/etc/吧，有中二強(qiáng)迫癥。
2. 編譯三個(gè)東西alm;anphon;tools
   • alm
     進(jìn)入到/home/zhangsan/etc/alamode/alm目錄,然后cp Makefile.linux Makefile
     然后修改Makefile的前幾行，如下：

     CXX = icpc  #注意icpc有沒有
     CXXFLAGS = -O2 -xHOST -qopenmp -std=c++11 # 注意是不是qopenmp
     INCLUDE = -I../include -I$(HOME)/include -I/home/zhangsan/include/spblib/include # 大力出奇跡直接給spblib的絕對路徑
     
     CXXL = ${CXX}
     LDFLAGS = -mkl -L/home/zhangsan/include/spglib/lib -lsymspg # 大力出奇跡直接給spblib的絕對路徑
     

     然后編譯

     make -j
     

   • anphon
     進(jìn)入到/home/zhangsan/etc/alamode/anphon目錄,然后cp Makefile.linux Makefile
     然后修改Makefile的前幾行，如下：

      MPICXX = mpiicpc #是不是mpiicpc
      CXXFLAGS = -O3 -xHOST -qopenmp -D_FE_BUBBLE -std=c++11 #是不是qopenmp 這里-D_FE_BUBBLE我看別人帖子上加的
      INCLUDE = -I../include -I/home/zhangsan/include -I/home/zhangsan/include/spglib/include -I/home/zhangsan/intel1/compilers_and_libraries_2020.4.304/linux/mkl/include -I/home/zhangsan/intel1/compilers_and_libraries_2020.4.304/linux/mkl/include/fftw #直接暴力給滿
     
      LINKER = ${MPICXX}
      LDFLAGS = -mkl -L/home/zhangsan/include/spglib/lib -lsymspg #直接絕對路徑
     

     然后編譯

     make -j
     

   • tools

     #Intel compiler
     CXX = icpc #是不是icpc
     
     # OSX (gcc)
     #CXX = g++-9
     
     # OSX (clang)
     #CXX = g++
     
     # OSX
     #CXX = clang++
     
      CXXFLAGS = -O2 -std=c++11
     
     # Add the directory containing boost header files here
     INCLUDE = -I../include -I/home/zhangsan/include #直接絕對路徑
     

     然后編譯

     make -j
     

   • 安裝完后環(huán)境變量中指定命令

     # alamode
     alias alm=/home/one/etc/alamode/alm/alm
     alias anphon=/home/one/etc/alamode/anphon/anphon
     

     記得

     source .bashrc
     

詭異問題

有些迷的地方是：我用兩個(gè)alamode包編譯alm編譯成功anphon可能會失敗，反之亦然，我的方法是直接把編譯成功的拼湊起來，然后就是完整的了。