prefetch 使用

prefetch --option-file SRR_Acc_List.txt

sra數(shù)據(jù)會(huì)下載到家目錄下的ncbi/public/sra中，perfetch 默認(rèn)aspera下載（如果存在于環(huán)境變量，否則使用https下載）。
此外，也可設(shè)置aspera，Ex：prefetch -t ascp -a "/opt/aspera/bin/ascp|/opt/aspera/bin/asperaweb_id_dsa.openssh" --option-file file.txt; file.txt 格式為每一行一個(gè)SRR#，可以使用下載界面的RunInfo table下載的文件。
RNAseq的數(shù)據(jù)下載的格式為sra。
接下來要在網(wǎng)頁要看測序數(shù)據(jù)是單端還是雙端數(shù)據(jù)。

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