環(huán)境配置
這次使用的是阿里云的云服務(wù)器ECS，選擇的是Ubuntu系統(tǒng)，所以里面自帶apt-get，如果買的是輕量應(yīng)用服務(wù)器的話就是CentOS系統(tǒng)里面沒有自帶apt
apt是一個(gè)Ubuntu系統(tǒng)上一個(gè)軟件管理的工具，能夠幫助你自動(dòng)安裝軟件
但是如果直接安裝Docker的話不能直接安裝上最新的版本，所以需要先更新源，把docker的下載地址導(dǎo)入到apt的軟件安裝源里面
# 更新源
sudo apt update
#安裝Docker依賴的軟件
sudo apt install apt-transport-https ca-certificates curl gnupg-agent software-properties-common
#添加需要的安裝來源
curl -fsSL https://download.docker.com/linux/ubuntu/gpg | sudo apt-key add - #下載源將其添加到apt的安裝里面
sudo add-apt-repository "deb [arch=amd64] https://download.docker.com/linux/ubuntu $(lsb_release -cs) stable" #對(duì)剛剛安裝的源進(jìn)行注冊(cè)
#安裝docker以及器需要的別的包
sudo apt install docker-ce docker-ce-cli containerd.io
#添加用戶因?yàn)槠胀ㄓ脩舨荒苁褂胐ocker
#當(dāng)然我們買的云服務(wù)器是root權(quán)限的，所以可以不需要添加用戶
sudo usermod -aG docker 用戶名
# 查看docker是否正常啟動(dòng)
sudo service docker status
docker正常啟動(dòng)情況
Docker正常運(yùn)行
小tips:查看服務(wù)器的系統(tǒng)
我還以為阿里云服務(wù)器默認(rèn)系統(tǒng)就是Ubuntu系統(tǒng)，沒想到輕量級(jí)應(yīng)用服務(wù)器用的是centos系統(tǒng)
然后去到官網(wǎng)找到相應(yīng)的系統(tǒng)的下載方法
Install Docker Engine on Ubuntu
lsb_release -a # 查看服務(wù)器的版本號(hào)
管理docker服務(wù)
docker 需要一個(gè)后臺(tái)的守護(hù)進(jìn)程,這個(gè)守護(hù)進(jìn)程可以用下面命令管理
sudo service docker start #啟動(dòng)docker服務(wù)
sudo service docker restart #重啟服務(wù)
sudo service docker stop #暫停服務(wù)
sudo service docker status #確認(rèn)docker的運(yùn)行狀態(tài)
下載管理docker鏡像
這里需要到docker的官網(wǎng)去查找需要的鏡像Docker Hub（https://hub.docker.com/）
查找鏡像
去里面搜索需要的鏡像然后復(fù)制代碼即可
docker中的鏡像都是放在一個(gè)公共的地方統(tǒng)一進(jìn)行管理的，所以在下載鏡像之后不會(huì)直接看到鏡像存在的目錄，但是如果是同一個(gè)服務(wù)器下的用戶也能看到別人的鏡像
# 下載 最新的Ubuntu鏡像
docker pull ubuntu
# 查看所有的鏡像
docker images
#刪除指定的鏡像
docker rmi ubuntu（名字或者ID號(hào)）
# 搜索需要的鏡像
docker search
# 下載進(jìn)行
docker pull
管理容器
#使用交互模式it啟動(dòng)ubuntu容器 并且進(jìn)入到bash里面
docker run -it ubuntu bash
# 退出Ubuntu容器
exit
# 查看所有的容器
docker ps -a
# 交互式啟動(dòng)容器
docker exec -it 5479ee15b24f bash
# 直接運(yùn)行容器
docker exec 5479ee15b24f pwd
# 停止容器
docker stop 5479ee15b24f
# 刪除容器
docker rm 5479ee15b24f
在Ubuntu中安裝blast軟件
#創(chuàng)建交互模式的Ubuntu
docker run -it ubuntu bash
# 使用apt來安裝wget
apt update
apt install wget
# 使用官網(wǎng)鏈接來下載blast
wget https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.12.0+-x64-linux.tar.gz
tar -zxvf ncbi-blast-2.12.0+-x64-linux.tar.gz #解壓
# 測(cè)試blast能否使用
/opt/ncbi-blast-2.12.0+/bin/blastp
制作鏡像
#將安裝有blast的Ubuntu容器制作成指定名稱的鏡像
docker commit -m 'add blast' 6c09e5192928 xyf/blast
