腳本更新--細(xì)胞類型、通路、TF、配受體共定位分析(visium)

作者,Evil Genius

今天我們來(lái)更新腳本,其實(shí)現(xiàn)在對(duì)于visium、華大bin > 50的數(shù)據(jù)分析而言,細(xì)胞類型共定位已經(jīng)成了必須的分析內(nèi)容了。

尤其在精細(xì)化亞群的空間共定位更加重要



隨著分析的深入,擴(kuò)展到細(xì)胞類型與生物學(xué)通路的共定位分析

直到我們2024年開(kāi)始培訓(xùn)空間轉(zhuǎn)錄組的時(shí)候,進(jìn)一步擴(kuò)展到細(xì)胞類型、通路、TF、配受體共定位分析,視頻鏈接在B站2024第九課:細(xì)胞類型共定位(細(xì)胞類型、TF、通路)


2025年培訓(xùn)重點(diǎn)講了細(xì)胞類型的共定位

時(shí)至今日,這個(gè)分析我們需要更新了,24年的腳本已經(jīng)不能跑了,需要進(jìn)行腳本更新了,還是全流程腳本,python版本,實(shí)現(xiàn)細(xì)胞類型、通路、TF、配受體共定位分析。

全流程腳本如下

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