這本Nature旗下的6.4分SCI接收了經(jīng)典的生信數(shù)據(jù)挖掘預(yù)后模型文章!

注意:知識星球的用戶請自行去知識星球免費下載閱讀,無需付費! 非要付費我不給你退的。
我們都在說現(xiàn)在基于數(shù)據(jù)庫挖掘的預(yù)后模型文獻已經(jīng)爛大街了,然鵝!有人又默默的在一個 正統(tǒng)的6.4分雜志上發(fā)文章了,啥是正統(tǒng)呢?就是除外咱們耳熟能祥的經(jīng)典灌水雜志。
2020年5月13日 英國諾丁漢大學(xué)醫(yī)學(xué)院諾丁漢乳腺癌研究中心等單位學(xué)者發(fā)表的數(shù)據(jù)挖掘文章發(fā)現(xiàn)了一個: 基于兩個基因的預(yù)后標簽,影響因子 6.4分。

文章簡介

這項研究旨在使用下一代測序技術(shù)來探查TNBC切除樣品的轉(zhuǎn)錄組,以鑒定與疾病結(jié)果相關(guān)的新型生物標志物。文章應(yīng)用了兩個RNA-seq的 TNBC數(shù)據(jù)集,應(yīng)用了 supervised artificial neural network analysis進行降維篩選預(yù)后相關(guān)的基因,接下來應(yīng)用兩個外部數(shù)據(jù)集驗證這兩個基因:Breast Cancer Gene-Expression Miner v4. 0 and Genotype 2 outcome datasets。

多變量Cox回歸分析確定了與不良預(yù)后獨立相關(guān)的預(yù)后基因特征。最后,通過使用免疫組織化學(xué)的蛋白質(zhì)表達來證實兩個基因的預(yù)后結(jié)果。人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)確定了兩個基因panel,能預(yù)測遠處無轉(zhuǎn)移生存和乳腺癌特異性生存。對兩個panel共有的21個基因進行單變量Cox回歸分析后發(fā)現(xiàn),八個基因的表達水平與不良預(yù)后獨立相關(guān)p <0.05)。使用多因素Cox回歸分析調(diào)整臨床病理因素,包括患者的年齡,等級,淋巴結(jié)分期,腫瘤大小和淋巴管浸潤,產(chǎn)生了兩個基因的預(yù)后標簽,其與不良預(yù)后相關(guān)(p <0.05),獨立于其他預(yù)后變量。作者又進一步驗證了這兩個基因的蛋白表達,并以獨立和組合方式與患者預(yù)后顯著相關(guān)(p <0.05)。

小結(jié)一下

與常見的文章分析方案,僅僅是多了一步蛋白水平的驗證,可是人家發(fā)了6.4分哦?

圖表速覽

還有 72% 的精彩內(nèi)容
?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請聯(lián)系作者
【社區(qū)內(nèi)容提示】社區(qū)部分內(nèi)容疑似由AI輔助生成,瀏覽時請結(jié)合常識與多方信息審慎甄別。
平臺聲明:文章內(nèi)容(如有圖片或視頻亦包括在內(nèi))由作者上傳并發(fā)布,文章內(nèi)容僅代表作者本人觀點,簡書系信息發(fā)布平臺,僅提供信息存儲服務(wù)。
支付 ¥6.00 繼續(xù)閱讀

友情鏈接更多精彩內(nèi)容