????轉錄組測序是最常用的組學實驗，對全譜基因定量，找到差異表達基因。RNAseq涉及到原始數(shù)據(jù)，數(shù)據(jù)質控，基因組比對，差異基因鑒定，差異基因功能富集分析，重要基因如轉錄因子激酶的靶基因預測等，我們用10講的時間，全面講解轉錄組測序報告，及在上百個項目中遇到的近百個常見問題。
????本節(jié)視頻是第1講，從測序原始下機數(shù)據(jù)開始講起。樣品制備到產(chǎn)出測序數(shù)據(jù)過程，是RNA提取建庫和測序的試驗環(huán)節(jié)。在使用Illumina系列的儀器進行測序后，測序下機數(shù)據(jù)以fastq文件存儲，稱為raw data（或raw reads），記錄了轉錄組RNA序列的堿基組成信息。
本節(jié)內(nèi)容要點包括：
（1）如何查看fastq文件；
（2）fastq文件的基本格式，每一行的主要信息；
（3）如何在fastq文件中評估堿基質量，代表堿基質量的ASCII值和單堿基測序錯誤率之間怎樣換算；
（4）N堿基代表什么，常說的Q20、Q30等與測序質量間存在怎樣的關系，一般它們多少時代表測序質量是合格的；
（5）為什么一個樣本對應R1和R2兩個fastq文件，什么是雙端測序。
視頻教程：
紀偉講測序1-測序原始數(shù)據(jù)說明
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