Day-3 lzyazcr

今天的的任務(wù)是下載軟件~

確定系統(tǒng)位數(shù)

unmae -a

打開服務(wù)器目錄

cd  -/new

下載成功

wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

sh=Windows的exe

安裝程序

bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh 

激活軟件

source ~/.bashrc

添加鏡像

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes

教程實(shí)在太詳細(xì)了~

軟件使用

查看軟件列表

conda list###查看軟件列表

搜索軟件

conda search fastqc

安裝（不加-Y安裝中需要自己輸入一些指令）

conda install fastqc -y

卸載

conda remove fastqc

——————

conda環(huán)境

查看當(dāng)前conda環(huán)境

conda info --envs

建立新環(huán)境

conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic 

環(huán)境的激活~~

conda activate rna-seq