最近在做RNA-editing,縱觀文獻(xiàn)綜述,相關(guān)軟件很多,但是屬reditools獨(dú)領(lǐng)風(fēng)騷。不過(guò)還是想吐槽一下這個(gè)軟件,軟件是好軟件,就是文檔寫的也太不認(rèn)真了吧。。

reditools
今天先說(shuō)說(shuō)reditools1。
reditools1這個(gè)版本的特點(diǎn)是速度慢,reditools2在reditools1基礎(chǔ)上做出了優(yōu)化,速度更快了。而且是快的多。。
reditools的安裝有個(gè)小毛病:
首先我們要安裝依賴包:python2,fisher,pblat,samtools,tabix。
然后
git clone https://github.com/BioinfoUNIBA/REDItools
cd REDItools
python setup.py install
然而總出現(xiàn)下面這個(gè)毛病

image.png
原來(lái)是需要
mv README.md README
然后就可以了。。。。
作者大佬怎么能犯這種錯(cuò)誤呢???
好了,下期再來(lái)吐槽reditools2吧