學(xué)習(xí)內(nèi)容
怎么區(qū)分一二三代測序
二代測序大體流程
NGS組學(xué)都包括哪些分類
1. 一二三代測序
第一代DNA測序技術(shù)Sanger-雙脫氧鏈終止法是最為經(jīng)典的一代測序技術(shù)。Sanger法是根據(jù)核苷酸某一固定的點(diǎn)開始,隨機(jī)在某一個(gè)特定的堿基處終止,并且在每個(gè)堿基后面進(jìn)行熒光標(biāo)記,產(chǎn)生以A、T、C、G結(jié)束的四組不同長度的一系列核苷酸,然后在尿素變性的PAGE膠上電泳進(jìn)行檢測,從而獲得可見DNA堿基序列的一種方法。成本高、通量低的傳統(tǒng)測序技術(shù)不能滿足深度測序和重復(fù)測序等大規(guī)?;蚪M測序的要求。
第二代DNA測序技術(shù)又稱下一代測序技術(shù),是對第一代測序技術(shù)的劃時(shí)代變革的核心。
主要平臺有:
(1) 羅氏454公司的GS FLX sequencer
(2) Illumina solexa genome analyzer
(3) ABI公司的SOLiD sequencer
二代測序大幅度提高了測序速度,降低了測序成本,保持了高準(zhǔn)確性。缺點(diǎn)是讀長短,拼接困難,pcr技術(shù)增加了測序的錯(cuò)誤率。
第三代測序技術(shù)是指單分子測序技術(shù)。DNA測序時(shí),不需要經(jīng)過PCR擴(kuò)增,實(shí)現(xiàn)了對每一條DNA分子的單獨(dú)測序。第三代測序技術(shù)也叫從頭測序技術(shù),即單分子實(shí)時(shí)DNA測序。
第三代測序技術(shù)的應(yīng)用在基因組測序、甲基化研究、突變鑒定(SNP檢測)這三個(gè)方面上。
2. 二代測序

二代測序.png