學習小組Day 6筆記--安心

安裝和加載R包

1.鏡像設置

[1]R的配置文件 .Rprofile

a 用file.edit()來編輯文件：file.edit('~/.Rprofile')
b 添加options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) #對應清華源
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")#對應中科大源 兩行代碼
c 保存=》重啟Rstudio，這時你再運行一下：options()$repos和options()$BioC_mirror就發(fā)現(xiàn)已經配置好了

options函數(shù)就是設置R運行過程中的一些選項設置

2 安裝

install.packages(“包”)#CRAN網站
BiocManager::install(“包”)#Biocductor

3.加載

library(包)
require(包)

生信星球

運行install.packages("dplyr")

1603873260(1).png

載入程輯包：‘dplyr’

library(dplyr)

dplyr五個基礎函數(shù)

示例數(shù)據test <- iris[c(1:2,51:52,101:102),]

示例數(shù)據

1.mutate(),新增列


新增列

2.select(),按列篩選
(1)按列號篩選


列號

(2)按列名篩選

列名

3.filter()篩選行
篩選行

4.arrange(),按某1列或某幾列對整個表格進行排序
arrange(test, Sepal.Length)#默認從小到大排序
1603875015(1).png

arrange(test, desc(Sepal.Length))#用desc從大到小

1603875042(1).png

5.summarise()：匯總
結合group_by使用實用性強
summarise(test, mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))# 計算Sepal.Length的平均值和標準差
1603875561(1).png

先按照Species分組，計算每組Sepal.Length的平均值和標準差

dplyr兩個實用技能

1：管道操作 %>% (cmd/ctr + shift + M)


1603875749(1).png

2：count統(tǒng)計某列的unique值
1603875994(1).png

dplyr處理關系數(shù)據

1.內連inner_join,取交集
2.左連left_join
3.全連full_join
4.半連接：返回能夠與y表匹配的x表所有記錄semi_join


1603877170(1).png

5.反連接：返回無法與y表匹配的x表的所記錄anti_join


1603877591(1).png

6.簡單合并
在相當于base包里的cbind()函數(shù)和rbind()函數(shù);注意，bind_rows()函數(shù)需要兩個表格列數(shù)相同，而bind_cols()函數(shù)則需要兩個數(shù)據框有相同的行數(shù)


1603877543(1).png

  1. (Rstudio最重要的兩個配置文件：在剛開始運行Rstudio的時候，程序會查看許多配置內容，其中一個就是.Renviron，它是為了設置R的環(huán)境變量;而.Rprofile就是一個代碼文件，如果啟動時找到這個文件，那么就替我們先運行一遍（這個過程就是在啟動Rstudio時完成的） ?

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