今天是生信學(xué)習(xí)的的第四天，今天學(xué)習(xí)了R語(yǔ)言的安裝以及一些基礎(chǔ)的操作。
R語(yǔ)言也是生信學(xué)習(xí)的重要一環(huán)，不過相比其他的生信軟件而言，r語(yǔ)言可以直接在Windows上安裝使用（也有Linux版本的）。
1. R語(yǔ)言的介紹
R是一種編程語(yǔ)言，也是統(tǒng)計(jì)計(jì)算和繪圖的環(huán)境，它匯集了許多函數(shù)，能夠提供強(qiáng)大的功能。
R語(yǔ)言軟件界面簡(jiǎn)陋，通常不直接使用，而是用圖形界面的Rstudio。
RStudio是免費(fèi)提供的開源集成開發(fā)環(huán)境（IDE）。RStudio提供了一個(gè)具有很多功能的環(huán)境，使R更容易使用，是在終端中使用R的絕佳選擇。
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2. 安裝R語(yǔ)言前的準(zhǔn)備
因?yàn)镽Studio安裝的途徑需要系統(tǒng)名稱是英文的，否則安裝以后會(huì)無法正常使用。那么如何判斷系統(tǒng)名是否為英文的步驟如下：
2.1 隨便打開一個(gè)文件夾，點(diǎn)擊圖中紅色方框的圖標(biāo)
2.2 顯示如圖所示的路徑，就表明是英文的系統(tǒng)名，可以直接安裝
2.3 若顯示路徑前幾級(jí)目錄為中文，就需要做出更改
詳細(xì)更改步驟見當(dāng)Rstudio杠上中文用戶名
3. 下載安裝R語(yǔ)言程序（R\RStudio）
具體過程見果子學(xué)生信安裝教程,在此就不做詳細(xì)介紹了。
4. 簡(jiǎn)單認(rèn)識(shí)R和Rstudio
打開R和Rstudio的操作界面，我們發(fā)現(xiàn)，R略顯簡(jiǎn)陋，而Rstudio就相對(duì)豐富多了，存在多個(gè)工作界面，有腳本編輯器（左上）、環(huán)境顯示界面（右上）、控制臺(tái)（腳本運(yùn)行和結(jié)果顯示）(左下)以及文件/圖片/幫助/包的界面（右下）。這也使得我們能夠更好地使用R語(yǔ)言。
5. Rstudio的參數(shù)設(shè)置（以字體為例）
5.1 點(diǎn)擊上面的菜單欄的Tools，選擇Global Options項(xiàng)目
5.2 然后選擇Appearance欄，然后選擇自己需要更改的主題，字體等
5.3 更改完后，點(diǎn)擊Apply應(yīng)用更改的參數(shù)，然后確定即可。其他參數(shù)也是如此，不過具體的還需要自己去摸索。
6. R語(yǔ)言的一些基本操作
6.1 用Rproject管理工作目錄
所謂工作目錄就是默認(rèn)的讀取和儲(chǔ)存位置，也就是說，R語(yǔ)言只能和一個(gè)文件夾進(jìn)行互動(dòng)，這個(gè)文件夾非常重要，做不好就會(huì)導(dǎo)致你的腳本、文件、圖片各種亂跑，找不到。
----來自生信星球
觀看來源與生信星球的R-project管理多個(gè)R工作目錄,你就會(huì)得到更進(jìn)一步的了解。
6.2 顯示文件列表
> dir()
[1] "library"
輸入目錄查詢指令，結(jié)果就顯示一個(gè)"library"，就表明在當(dāng)前工作目錄下就存在一個(gè)子目錄。
6.3 加減乘除計(jì)算
> #加法
> 1+9
[1] 10
> #減法
> 2020-1995
[1] 25
> #乘法
> 13*14
[1] 182
> #除法
> 9/3
[1] 3
6.4 賦值
“<-”就表示賦值符號(hào)，z<-x-y,就表明將x-y的的結(jié)果賦值給了z，一旦在控制臺(tái)中輸入x后，得到的輸出結(jié)果就是x-y的值
6.5 刪除變量
這個(gè)命令和Linux的刪除命令類似都是使用rm()來刪除
a<-3
b <- 1
c <- 4
u <- 5+6
rm(b)
rm(u,c)
rm(list = ls())#清空所有變量
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6.6 查看歷史命令
有兩種方法：
一是輸入history()命令，二是在環(huán)境顯示界面（右上）的history欄目中查看
6.7 清空控制臺(tái)
當(dāng)輸入命令過多時(shí)，可以通過快捷鍵ctrl+l來清空，或者是直接點(diǎn)擊控制臺(tái)右上角的掃帚圖標(biāo)就可以清空記錄。
今天的學(xué)習(xí)就到這里了，明天再開始學(xué)習(xí)新的內(nèi)容，謝謝！
