原創(chuàng)：?胖丫?小麥研究聯(lián)盟?3天前

超容易的畫局部連鎖圖、局部共線性圖的方法

最近聽一個碩士師妹講了一個比較巧合的事情。

師妹碩士畢業(yè)進公司成了生信分析員。2年之后辭職打算考博。

初試過了，去面試，一共有10個人。大家按順序講講自己做了啥。

當其中某一個應(yīng)聘者講ppt時，她發(fā)現(xiàn)里邊的幾張圖很熟悉。

當時她沒反應(yīng)過來，以為就是相似而已。后頭一查發(fā)現(xiàn)，這些圖就來自她接的項目。

就是她曾經(jīng)服務(wù)的客戶，現(xiàn)在竟然出現(xiàn)在同一個面試場合。

幾天后，一個令她心塞的結(jié)果出現(xiàn)，她的客戶竟然被選上了。這其中還有她的“助攻”。

有時候不得不說，現(xiàn)實生活比導(dǎo)演還牛逼。

不過，師妹最終還是找到了一個好歸宿。

對，就是歸宿，因為她不僅考取了理想的讀博單位，在那里還遇到了另一半。

這期內(nèi)容比較干，所以拿師妹這事來說一說。

咱們言歸那個正傳。

這里只是畫局部區(qū)間的連鎖圖。凡是基于位置的圖都可以用這種方法畫。

工具就是excel、ppt，每臺電腦上都應(yīng)該有吧。

常年接觸連鎖作圖的人可能會知道MapDraw,一個基于excel繪制連鎖圖的宏腳本。

用它畫出的圖差不多如下圖所示。

image-20191101210902494

張軍利師兄17年的時候?qū)⑺脑炝讼?，這樣可以畫 interval和absolute的遺傳圖（如上圖）。這是軍利師兄的github地址（https://github.com/pinbo/MapDrawJZ），下載就好。

用微軟excel打開會詢問你是否啟用宏，選擇同意即可。

image-20191101211323141

輸入格式如下所示。兩列即可，第一列是遺傳距離，第二列是標記名字。輸入確認無誤之后，點擊紅色箭頭所示的DrawMap。

image-20191101211602449

然后會彈出如下所示的內(nèi)容。注意明白紅線標出的參數(shù)含義，這決定最后畫出的遺傳圖是否美觀。

image-20191101211749503

擠

是不是感覺有點擠，將第一個參數(shù)調(diào)成15試試。

還是有點擠

調(diào)整25呢？

這下好了

在excel中選中之后，復(fù)制到ppt里，然后就可以魔改這張遺傳圖的任何元素了。

先選中，然后“排列”，然后“取消組合”。

在排列下拉表里

紅色字體加粗

水平翻轉(zhuǎn)

旋轉(zhuǎn)90度

添加QTL

橫過來

丑

巨丑（忽略我放蕩不羈的配色吧）

關(guān)于形狀，ppt里選中目標形狀，然后右鍵會有個“編輯頂點”，選擇之后可以任意調(diào)整形狀。

今天到此為止了。此文重在給那些暫時不會用R、python等畫圖的一個參考吧，重在打開思路，請大家忽略這巨丑的圖片。配色啥的請參考發(fā)表的文章。要想畫一幅好圖，還是需要花功夫的。

聽說隔壁的TBtools（https://github.com/CJ-Chen/TBtools）也能畫。

參考：

https://github.com/pinbo/MapDrawJZ

劉仁虎，孟金陵 (2003) MapDraw，在Excel中繪制遺傳連鎖圖的宏。遺傳, 25(3): 317-321